180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0783 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 69 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  65.22 
 
 		 115 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  63.77 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  65.22 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  67.65 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 		 69 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 		 70 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  59.42 
 
 		 113 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  62.12 
 
 		 71 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  58.82 
 
 		 76 aa  73.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 69 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  50.75 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  50.79 
 
 		 71 aa  67  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  53.12 
 
 		 68 aa  67  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  57.81 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  55.07 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  50.75 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  51.56 
 
 		 70 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  50.77 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  53.33 
 
 		 93 aa  60.1  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  48.53 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  51.67 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  45.16 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  48.39 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  46.15 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  56.25 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0090  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  55 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  40.3 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  44.83 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  47.89 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  43.86 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 856 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  46.27 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  49.23 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0033  heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  43.55 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  34.33 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  39.68 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1021  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  45.45 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 827 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  47.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  43.55 
 
 		 732 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  48.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  48.33 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2449  Heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.228051  normal  0.0680079 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 732 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 891 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 823 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  41.94 
 
 		 732 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 797 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  39.06 
 
 		 792 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.55 
 
 		 473 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  47.54 
 
 		 803 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  41.94 
 
 		 732 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  42.5 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 704 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  40.62 
 
 		 792 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  37.31 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  41.67 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 814 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 799 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0030  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 738 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1770  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 833 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466884 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>