256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4327 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
76 aa  153  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  56.92 
 
 
71 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  56.92 
 
 
71 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  52.11 
 
 
74 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 
69 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  42.65 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  51.56 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  42.25 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  39.39 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  37.31 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  52.46 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  42.42 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
78 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  34.85 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1877  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  53.19 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.33 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  32.81 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  36.67 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  42.37 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  42.19 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  40.91 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  44.07 
 
 
65 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  36.76 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
69 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  47.69 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  37.5 
 
 
69 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 
73 aa  52  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  38.71 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
70 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  39.13 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
160 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
65 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
68 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  42.65 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
66 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5705  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5304  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.562582  normal  0.337627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3669  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.792064  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3162  heavy metal binding protein  45.45 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1386  Heavy metal transport/detoxification protein  46.77 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  hitchhiker  0.000957123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  40 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  35.29 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0656  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00657939  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0663  heavy metal transport/detoxification protein  45.9 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0937  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.543805 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1081  heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4871  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.800618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  37.1 
 
 
70 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  40.32 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  44.23 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
102 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  40.91 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.39 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1553  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 
859 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.534956  normal  0.0124284 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  34.92 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
833 aa  48.9  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1752  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  38.33 
 
 
826 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  41.94 
 
 
70 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 
839 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  34.25 
 
 
748 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
1021 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  37.5 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
1021 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
971 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.1 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
867 aa  47.4  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
797 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  34.38 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 
66 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  37.31 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  40 
 
 
79 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40.62 
 
 
67 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  33.82 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  36.51 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>