209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_19780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_19780  copper chaperone  100 
 
 		 71 aa  140  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10610  copper chaperone  75 
 
 		 69 aa  103  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.201144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4552  heavy metal transport/detoxification protein  70.15 
 
 		 70 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.939957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1450  heavy metal transport/detoxification protein  63.77 
 
 		 113 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1468  heavy metal transport/detoxification protein  66.67 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4497  heavy metal transport/detoxification protein  69.23 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.499051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0910  heavy metal transport/detoxification protein  68.66 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2847  heavy metal transport/detoxification protein  68.66 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.179669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0783  Heavy metal transport/detoxification protein  62.12 
 
 		 69 aa  81.3  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.591809  normal  0.0129962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4020  Heavy metal transport/detoxification protein  61.76 
 
 		 76 aa  75.1  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.343869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5838  Heavy metal transport/detoxification protein  59.68 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  60.32 
 
 		 69 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  53.85 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3354  heavy metal transport/detoxification protein  59.09 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.702383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  57.14 
 
 		 70 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0091  Heavy metal transport/detoxification protein  54.84 
 
 		 68 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  52.31 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  56.45 
 
 		 68 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4548  Heavy metal transport/detoxification protein  56.36 
 
 		 70 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  55.22 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  50.75 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  53.97 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  53.73 
 
 		 78 aa  63.5  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0467  Heavy metal transport/detoxification protein  52.17 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3704  hypothetical protein  56.67 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660005  normal  0.139636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2601  Heavy metal transport/detoxification protein  49.21 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.854669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2471  Heavy metal transport/detoxification protein  52.24 
 
 		 108 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1741  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 73 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.246039  decreased coverage  0.0020488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  49.25 
 
 		 69 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0015  hypothetical protein  55 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4238  Heavy metal transport/detoxification protein  46.03 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3444  Heavy metal transport/detoxification protein  50.75 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129819  hitchhiker  0.00605646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4448  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.866926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  57.58 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4588  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  53.23 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3668  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0014  copper ion binding protein  52.31 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0115  Heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1163  Heavy metal transport/detoxification protein  56.45 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1695  Heavy metal transport/detoxification protein  58.73 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.583772  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  46.88 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  52.11 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6127  heavy metal transport/detoxification protein  53.23 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0154405  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0323  heavy metal transport/detoxification protein  44.44 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.228429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23420  hypothetical protein  61.54 
 
 		 49 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0366798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  46.38 
 
 		 132 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  38.98 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 790 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2045  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0135722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3258  Heavy metal transport/detoxification protein  43.48 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 799 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  38.46 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  39.06 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36140  copper chaperone  45.45 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.237573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2500  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.711261 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3872  Heavy metal transport/detoxification protein  41.18 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00330902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  41.94 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4098  heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2086  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000331725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0420  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  37.88 
 
 		 565 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 872 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  43.75 
 
 		 67 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0489  heavy metal transport/detoxification protein  48.33 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 856 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  39.39 
 
 		 561 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0141  Heavy metal transport/detoxification protein  45.59 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  44.44 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  42.19 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  36.76 
 
 		 817 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  34.92 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  37.1 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  36.36 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  37.5 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 976 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  36.07 
 
 		 561 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  37.5 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5745  heavy metal transport/detoxification protein  48.21 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0133712 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>