More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2511 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  100 
 
 
99 aa  194  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  54.84 
 
 
98 aa  91.3  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  50.55 
 
 
97 aa  85.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  51.65 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  51.04 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  47.25 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  50.54 
 
 
92 aa  80.9  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  55.41 
 
 
94 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  53.95 
 
 
91 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  47.31 
 
 
91 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  50.62 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  50 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  55.71 
 
 
90 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  54.67 
 
 
91 aa  77  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  54.05 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  51.61 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  50.54 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  45.35 
 
 
98 aa  74.7  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  50 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  48.31 
 
 
94 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  45.56 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 
91 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  48.39 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  51.43 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  51.43 
 
 
91 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  52.86 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  52.86 
 
 
95 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  52.11 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  51.43 
 
 
108 aa  68.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  48.57 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  44.21 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  44.59 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  48.57 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  47.14 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
816 aa  62.4  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
1071 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  45 
 
 
811 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
811 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
1087 aa  57  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
836 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  43.28 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  50.77 
 
 
790 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  46.03 
 
 
795 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
825 aa  55.5  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
838 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
797 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  44.3 
 
 
1063 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
1063 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  44.3 
 
 
1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
1061 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 
835 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.54 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
754 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
797 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
816 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.62 
 
 
833 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
887 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
837 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  47.14 
 
 
872 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
836 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
849 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  43.08 
 
 
562 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
836 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  33.82 
 
 
954 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 
841 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 
68 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  43.28 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
871 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 
795 aa  51.2  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  37.68 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  40.32 
 
 
71 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
798 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 
830 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 
938 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
836 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1259  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
834 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.499676  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 
1182 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 
971 aa  50.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.62 
 
 
67 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
798 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
798 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
824 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  29.23 
 
 
834 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
823 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
1040 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 
806 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 
741 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2554  heavy metal transport/detoxification protein  44.12 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.185355  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
793 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
813 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  29.17 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>