157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02043 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02043  Mercury scavenger protein:Heavy-metal-associated domain  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.525841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  62.34 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  60 
 
 		 92 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  51.25 
 
 		 98 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  64.86 
 
 		 91 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  58.9 
 
 		 91 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  57.5 
 
 		 95 aa  90.1  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  64.38 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 90 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  55.07 
 
 		 91 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  55.07 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  59.42 
 
 		 91 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  51.76 
 
 		 98 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  51.22 
 
 		 100 aa  84.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  59.42 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  59.42 
 
 		 95 aa  84.7  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  56.52 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  57.14 
 
 		 91 aa  83.6  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  55.56 
 
 		 94 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  50.68 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  51.39 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  46.51 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  53.52 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  51.35 
 
 		 99 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  43.75 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  39.74 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  45.59 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  39.74 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  47.22 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  39.74 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  40.24 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  41.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2066  mercuric transport protein periplasmic component  39.02 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.131974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  42.31 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  44.78 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  30.56 
 
 		 954 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  29.58 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  30.88 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  40.62 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  27.14 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  28.99 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 785 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  35.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 752 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 871 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  43.08 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 825 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  38.24 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1945  mercuric transport protein periplasmic component  46.25 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.230476  normal  0.0101145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1305  Heavy metal transport/detoxification protein  34.62 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.921756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 890 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  34.85 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2871  heavy metal transport/detoxification protein  36.11 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3058  heavy metal transport/detoxification protein  34.62 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 759 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1251  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 806 aa  45.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000992397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3281  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 699 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3215  heavy metal transport/detoxification protein  34.62 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.501127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 816 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  29.23 
 
 		 758 aa  45.4  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 		 758 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.14474  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 861 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 838 aa  45.1  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2967  heavy metal transport/detoxification protein  34.72 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.986526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 806 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3072  heavy metal transport/detoxification protein  34.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 806 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 837 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  27.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  27.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  27.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  27.78 
 
 		 196 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  31.67 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 866 aa  44.7  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2788  heavy metal transport/detoxification protein  34.72 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.863319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1442  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 791 aa  44.3  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.153784  normal  0.0826398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 849 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0564  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 789 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  31.94 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  39.68 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.38 
 
 		 833 aa  43.9  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  33.87 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  28.95 
 
 		 942 aa  43.9  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 876 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 471 aa  43.9  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 759 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 759 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2989  Heavy metal transport/detoxification protein  36.36 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  29.85 
 
 		 805 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.85 
 
 		 805 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 798 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>