176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02958 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  100 
 
 		 61 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  59.02 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  50.82 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  50.82 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  52.54 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  50.82 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  45.9 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  47.54 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0169  mercuric transport protein periplasmic component  50.82 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  50.82 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  47.54 
 
 		 91 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  47.54 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  47.54 
 
 		 91 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  46.67 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  47.54 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  45.76 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  49.18 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3490  mercuric transport protein periplasmic component  47.54 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  49.18 
 
 		 95 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  45.9 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  49.12 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  52.63 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  42.37 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0239  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  45.61 
 
 		 94 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  44.07 
 
 		 90 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  44.26 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  45.76 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  40.98 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 942 aa  52.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  47.54 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  40.35 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 797 aa  52.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1340  mercuric transport protein periplasmic protein  44.07 
 
 		 108 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.023175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 861 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 817 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4417  mercuric transport protein periplasmic protein  40.35 
 
 		 94 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.192588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 839 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  39.29 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 837 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  38.6 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 857 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  47.27 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 820 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 836 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 836 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2255  copper-translocating P-type ATPase  50.91 
 
 		 869 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4950  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 748 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 818 aa  47.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  36.84 
 
 		 799 aa  47  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  40 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 806 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 838 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 740 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 837 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  42.62 
 
 		 748 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 816 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 1071 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  34.48 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  34.48 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  52.73 
 
 		 730 aa  46.2  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 866 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  37.29 
 
 		 954 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  41.07 
 
 		 793 aa  45.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 851 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 		 806 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 754 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  36.21 
 
 		 69 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  38.18 
 
 		 828 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 821 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 821 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 889 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.88 
 
 		 833 aa  44.3  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 828 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 720 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 890 aa  43.9  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 837 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 797 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 1087 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30.91 
 
 		 889 aa  43.5  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 71 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 798 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 806 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 814 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 786 aa  42.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 755 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>