223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1541 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
125 aa  249  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  41.43 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  42.86 
 
 
125 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  40.58 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
837 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
1071 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  43.75 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2684  heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
831 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
95 aa  54.7  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0959  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
761 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  43.75 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  38.89 
 
 
91 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  43.4 
 
 
759 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  43.4 
 
 
759 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  43.06 
 
 
744 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  31.4 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
889 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  42.19 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
976 aa  51.6  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
889 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  39.06 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
740 aa  51.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  36.92 
 
 
71 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
806 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  36.71 
 
 
817 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
795 aa  51.2  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  45.71 
 
 
730 aa  51.2  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
739 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  37.33 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 
826 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0600  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
720 aa  49.7  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000362838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  35.21 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 
820 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
836 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  38.46 
 
 
90 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  28 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.5 
 
 
833 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  36.36 
 
 
73 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
1013 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
723 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0614  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 
726 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000274586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
797 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2902  mercuric transport protein periplasmic component  38.03 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  37.5 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
837 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  38.33 
 
 
723 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
937 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  47.27 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 
797 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
1021 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
1021 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
71 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
744 aa  47.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
942 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
758 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  38.03 
 
 
70 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
815 aa  46.2  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
836 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01410  periplasmic mercuric ion binding protein MerP  42.11 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  34.94 
 
 
98 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
837 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
798 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4796  mercuric transport protein periplasmic protein  33.82 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  44.68 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4423  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
817 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.332759  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0243  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 
833 aa  45.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
946 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  30.4 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  46.55 
 
 
795 aa  45.8  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4012  mercuric transport protein periplasmic component  31.51 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
867 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
821 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  29.89 
 
 
754 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
724 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  31.58 
 
 
209 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  48.89 
 
 
805 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  42.62 
 
 
796 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01591  putative P-type ATPase transporter for copper  29.33 
 
 
765 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.443919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  33.73 
 
 
824 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>