284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11673 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  100 
 
 
195 aa  395  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3089  heavy metal transport/detoxification protein  59.28 
 
 
199 aa  257  8e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6742  Heavy metal transport/detoxification protein  42.93 
 
 
196 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685267 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  29.69 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4361  heavy metal transport/detoxification protein  26.78 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1219  heavy metal transport/detoxification protein  26.78 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4383  heavy metal transport/detoxification protein  26.78 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2980  heavy metal transport/detoxification protein  26.78 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2837  Heavy metal transport/detoxification protein  26.83 
 
 
372 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0093  putative mercuric transport protein  33.96 
 
 
116 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
743 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  36.9 
 
 
836 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.82 
 
 
889 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  35.29 
 
 
889 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1873  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
821 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 
894 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  32 
 
 
926 aa  55.1  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
821 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  32.86 
 
 
826 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4342  putative mercuric transport protein  32.73 
 
 
131 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0239  putative mercuric transport protein  30 
 
 
116 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 
750 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 
471 aa  53.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  31.4 
 
 
125 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  32.05 
 
 
803 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
75 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  38.1 
 
 
560 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0485  putative mercuric transport protein  31.31 
 
 
116 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4013  putative mercuric transport protein  29.91 
 
 
118 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 
839 aa  52  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
817 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0114  mercuric transport protein  32.08 
 
 
116 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
759 aa  51.6  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
621 aa  51.6  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
806 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
818 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  40.62 
 
 
70 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
798 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2270  putative mercuric transport protein  32.11 
 
 
123 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.516173  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02959  MerT mercuric transport protein  33.64 
 
 
117 aa  50.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000916809  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  32.81 
 
 
91 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
758 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  36.21 
 
 
91 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1394  putative mercuric transport protein  28.57 
 
 
116 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0102  putative mercuric transport protein  32.43 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6497  putative mercuric transport protein  32.43 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  30.88 
 
 
753 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 
942 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1475  putative mercuric transport protein  32.11 
 
 
123 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.464723  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2340  putative mercuric transport protein  32.43 
 
 
116 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  30 
 
 
98 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
806 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0082  putative mercuric transport protein  31.82 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.680635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0484  mercuric transport protein periplasmic component  35.71 
 
 
92 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1212  Mercuric transport protein MerT  31.82 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.158107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2130  putative mercuric transport protein  31.82 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  32.81 
 
 
91 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4487  heavy metal transport/detoxification protein  28.79 
 
 
78 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.206644  normal  0.0472192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 
805 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
815 aa  49.3  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 
867 aa  48.9  0.00004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2231  putative mercuric transport protein  30.63 
 
 
116 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751686  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  31.75 
 
 
67 aa  49.3  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
849 aa  49.3  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  29.31 
 
 
954 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1216  putative mercuric transport protein  30.91 
 
 
116 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6172  putative mercuric transport protein  31.53 
 
 
116 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000473397  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6345  mercuric ion transport protein MerT  31.53 
 
 
116 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000789879  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15475  putative mercuric transport protein  31.53 
 
 
116 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000305934  unclonable  3.76194e-22 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 
802 aa  48.9  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
795 aa  48.9  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
797 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  30.43 
 
 
499 aa  48.5  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  28.99 
 
 
826 aa  48.1  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  34.38 
 
 
95 aa  48.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  26.87 
 
 
91 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
798 aa  48.5  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5991  mercury transporter MerT  30.09 
 
 
115 aa  48.5  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.681838 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  23.46 
 
 
887 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  34.38 
 
 
95 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  31.34 
 
 
754 aa  48.1  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00260  putative copper transport-related membrane protein  33.87 
 
 
741 aa  48.1  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.348825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  32.31 
 
 
833 aa  47.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  31.43 
 
 
820 aa  48.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 
890 aa  47.8  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
801 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  29.23 
 
 
759 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
737 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
737 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
737 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 
802 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 
828 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  29.23 
 
 
759 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 
802 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>