128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1507 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
71 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  81.43 
 
 
71 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0484  heavy metal transport/detoxification protein  68.57 
 
 
98 aa  104  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.591336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0412  heavy metal transport/detoxification protein  74.65 
 
 
71 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  70 
 
 
70 aa  97.4  5e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
723 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
723 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
69 aa  48.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
798 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.5 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
798 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  25.37 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  25.37 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  29.82 
 
 
68 aa  47  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2097  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
72 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.712519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  38.89 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  28.12 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  25.37 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  25.76 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  25.37 
 
 
91 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  25.76 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  37.25 
 
 
804 aa  45.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
723 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  22.39 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  28.12 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  25.86 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 
861 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  27.59 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  34.33 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  30.61 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
894 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  22.39 
 
 
90 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01591  putative P-type ATPase transporter for copper  30.88 
 
 
765 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.443919  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 
856 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  39.22 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  27.54 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 
889 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  37.74 
 
 
499 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01501  putative P-type ATPase transporter for copper  30.88 
 
 
764 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
758 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  25.37 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  36.73 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  36.73 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
724 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
817 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  38.46 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  35.19 
 
 
1055 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  36.21 
 
 
195 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  31.75 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  30.77 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  23.88 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
889 aa  42.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  24.24 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  45.71 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  22.73 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  23.88 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  32.08 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
820 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 
891 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
759 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  31.58 
 
 
71 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
759 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  31.67 
 
 
67 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  28.85 
 
 
756 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
796 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
759 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.03 
 
 
794 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  20.9 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01481  putative P-type ATPase transporter for copper  29.41 
 
 
764 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  34.29 
 
 
743 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
828 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
744 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  34.62 
 
 
828 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
795 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  38.78 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 
826 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.36 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
793 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  40 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 
849 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>