121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0423 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
71 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  81.43 
 
 
71 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0412  heavy metal transport/detoxification protein  80 
 
 
71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0484  heavy metal transport/detoxification protein  75.71 
 
 
98 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.591336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  78.57 
 
 
70 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6496  mercuric transport protein periplasmic protein  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.43034  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6173  Hg(II) resistance protein MerP  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000203357  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6346  Hg(II) resistance protein MerP  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000621364  unclonable  0.0000000448474 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15470  periplasmic mercuric ion binding protein, MerP  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000149366  unclonable  3.5058299999999997e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0103  mercuric transport protein periplasmic component  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.608406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2339  mercuric transport protein periplasmic component  29.85 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.832464  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0081  mercuric transport protein periplasmic component  31.34 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.675229 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2131  mercuric transport protein periplasmic component  31.34 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 
723 aa  51.2  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
68 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
861 aa  50.4  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1215  periplasmic mecuric binding protein, MerP  28.36 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4343  mercuric transport protein periplasmic component  28.36 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  29.85 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  29.85 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  26.47 
 
 
90 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 
723 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  32.65 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  41.51 
 
 
65 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  36.17 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  26.87 
 
 
91 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
723 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  38.6 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1568  heavy metal translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
758 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  29.85 
 
 
91 aa  47  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2097  heavy metal transport/detoxification protein  31.94 
 
 
72 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.712519 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  25.86 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  32.65 
 
 
820 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0657  copper-translocating P-type ATPase  29.82 
 
 
724 aa  45.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.737443  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1393  mercuric transport protein periplasmic component  28.36 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4541  heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  37.5 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1541  heavy metal transport/detoxification protein  37.04 
 
 
125 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.45566  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
756 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2230  mercuric transport protein periplasmic protein  23.88 
 
 
91 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  27.27 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 
71 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  26.15 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0926  Heavy metal transport/detoxification protein  34.09 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02958  putative mercuric transport protein periplasmic binding protein  33.33 
 
 
61 aa  43.9  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000221082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  39.02 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
942 aa  42.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  41.46 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  32.65 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  32.65 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  31.43 
 
 
69 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
891 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2328  heavy metal transport/detoxification protein  25 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1476  mercuric transport protein periplasmic component  26.09 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.241266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  43.9 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
744 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  24.24 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1705  Heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0720999  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1538  Heavy metal transport/detoxification protein  26.98 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0133712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1862  heavy metal-binding protein, putative  26.98 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
894 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21360  copper chaperone  42.5 
 
 
72 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.883325  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5319  Heavy metal transport/detoxification protein  35.71 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  28.12 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  31.48 
 
 
1055 aa  42  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  29.09 
 
 
954 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0485  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
724 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.265664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0674  Heavy metal transport/detoxification protein  26.92 
 
 
68 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
794 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
759 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  28.12 
 
 
67 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  36.73 
 
 
77 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 
826 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2845  heavy metal translocating P-type ATPase  32.69 
 
 
775 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 
759 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
817 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11673  probable copper-transporting ATPase  36.21 
 
 
195 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  30.61 
 
 
887 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
866 aa  41.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.93 
 
 
818 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  34.62 
 
 
828 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.09 
 
 
798 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  33.33 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2511  mercuric transport protein periplasmic protein  22.06 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.356859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01591  putative P-type ATPase transporter for copper  30.88 
 
 
765 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.443919  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  27.59 
 
 
793 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  25.76 
 
 
856 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.09 
 
 
798 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0711  Heavy metal transport/detoxification protein  26.23 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  23.64 
 
 
839 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 
828 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.17 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  28.26 
 
 
74 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0277616 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>