205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1053 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  54.41 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1666  copper ion binding protein  46.27 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1659  copper ion binding protein  47.69 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.842806 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  45.9 
 
 		 1196 aa  62.8  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  46.38 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2476  Heavy metal transport/detoxification protein  40.3 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.270205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  50 
 
 		 71 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  38.46 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  36.36 
 
 		 68 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1389  Mercuric transport protein MerT  35.82 
 
 		 209 aa  52  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000264548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 836 aa  51.6  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3067  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 824 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  42.42 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3237  Heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.28951  normal  0.700425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1785  mercuric transport protein periplasmic component  34.33 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.37235  normal  0.942363 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 887 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2271  mercuric transport protein periplasmic component  34.85 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.618304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  39.71 
 
 		 954 aa  50.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0423  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 71 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4424  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2844  Heavy metal transport/detoxification protein  43.94 
 
 		 68 aa  50.4  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2277  heavy metal transport/detoxification protein  39.66 
 
 		 59 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.938593  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 839 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1031  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 913 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 814 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  40 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  38.24 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  35.38 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3726  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.663439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 817 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2314  mercuric transport protein periplasmic protein  37.1 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118185  hitchhiker  0.0000281671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 938 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1299  mercuric transport protein periplasmic component  37.1 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0092  mercuric transport protein periplasmic component  35.48 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  40.91 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 891 aa  47.8  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 115 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0303  heavy metal transport/detoxification protein  34.48 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0412  heavy metal transport/detoxification protein  32.76 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2452  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 797 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.7313  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0789  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 820 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.222821 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  33.33 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 942 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 752 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  44.26 
 
 		 108 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1507  heavy metal transport/detoxification protein  29.82 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1211  mercuric transport protein periplasmic component  33.33 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.154152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01400  copper-exporting ATPase, putative  37.68 
 
 		 1055 aa  46.2  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 824 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 802 aa  46.6  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1467  heavy metal transport/detoxification protein  37.68 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0166  mercuric transport protein periplasmic component MerP  31.82 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.695125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 744 aa  46.2  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  32.79 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 837 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  32.79 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 759 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 855 aa  45.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  27.94 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 759 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.35 
 
 		 743 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28495  copper-transporting P-type ATPase  35.29 
 
 		 804 aa  46.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.105447  normal  0.5687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 885 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 867 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 871 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0240  mercuric transport protein periplasmic component  30.3 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0798  heavy metal transport/detoxification protein  38.24 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.885696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0890  mercuric reductase  35 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000328424  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 925 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>