More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0698 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  100 
 
 		 71 aa  141  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  87.32 
 
 		 71 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  56.92 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3412  copper ion binding protein  51.43 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0277616 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  39.39 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  44.26 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  44.64 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  40.91 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  45.31 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  44.62 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  49.23 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  45.9 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0534  copper ion binding protein  38.24 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0184287  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5882  Heavy metal transport/detoxification protein  41.79 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 759 aa  53.5  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  40.98 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0143  Heavy metal transport/detoxification protein  37.5 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.816482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  45.61 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  39.34 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  39.34 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1053  heavy metal transport/detoxification protein  42.42 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 835 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36750  copper chaperone  32.81 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.241771 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0823  heavy metal transport/detoxification protein  40.32 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 731 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  42.62 
 
 		 68 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0446  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.478739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2455  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000343237  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1651  heavy metal transport/detoxification protein  48.94 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 826 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0008  copper-translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 891 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2279  copper ion binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 841 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2139  heavy metal transport/detoxification protein  40.98 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  40.98 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  40.58 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3961  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0422606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  41.67 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3947  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.29 
 
 		 751 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  36.67 
 
 		 826 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4021  heavy metal transport/detoxification protein  46.67 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  39.39 
 
 		 68 aa  50.1  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0588  heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  36.36 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11220  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 925 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.363514 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  38.46 
 
 		 817 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 814 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3747  heavy metal transport/detoxification protein  39.68 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.37932  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4422  Heavy metal transport/detoxification protein  42.62 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687181  normal  0.662919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  37.93 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0627  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00214961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0633  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  39.34 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  41.54 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  40.68 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  37.29 
 
 		 1196 aa  48.5  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 839 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  35.38 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  36.07 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  32.26 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  41.67 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3891  Heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3349  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 757 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 824 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  41.82 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  41.82 
 
 		 954 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  41.38 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 856 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 827 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1795  Heavy metal transport/detoxification protein  38.71 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 811 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 811 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  37.1 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  43.75 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 827 aa  47.4  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0439  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 867 aa  47  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0018  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 70 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  33.85 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  37.7 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 855 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1492  heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>