More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0911 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 
78 aa  160  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  60.26 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  62.82 
 
 
76 aa  98.6  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  63.24 
 
 
79 aa  97.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  57.89 
 
 
76 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  56.76 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 
71 aa  80.1  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  48.05 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  41.79 
 
 
824 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  34.78 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 
836 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
889 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
711 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 
889 aa  57.4  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 
471 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  40.98 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  44.83 
 
 
762 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
836 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  44.62 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 
795 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
743 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 
832 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
799 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  41.67 
 
 
68 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  32.47 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
798 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
800 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 
798 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  47.83 
 
 
799 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
750 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
818 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  41.56 
 
 
724 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 
806 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
832 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  36.51 
 
 
68 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3238  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
831 aa  52.4  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.141164  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  43.28 
 
 
817 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  36.51 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
795 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 
833 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 
793 aa  51.6  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  34.29 
 
 
499 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0294  copper ion binding protein  42.19 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
894 aa  51.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
759 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  37.1 
 
 
67 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
806 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2772  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.35 
 
 
798 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
801 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
812 aa  50.4  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
734 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
723 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.85 
 
 
833 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 
835 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
799 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 
797 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40 
 
 
954 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
830 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.23 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  39.06 
 
 
765 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 
758 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.75 
 
 
798 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 
866 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  35 
 
 
826 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
826 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
797 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
795 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 
796 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
821 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
795 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
806 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
794 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 
839 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 
824 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  36.07 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4145  copper-translocating P-type ATPase  40 
 
 
778 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.418825  normal  0.147287 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  31.67 
 
 
815 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
840 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.09 
 
 
805 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  30.99 
 
 
787 aa  48.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1506  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
723 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  27.4 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  41.27 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.07 
 
 
837 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
833 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>