More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3294 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 72 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 71 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  59.15 
 
 		 75 aa  87.4  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  47.22 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 79 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  47.22 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  50 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 824 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  45.59 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 783 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  41.54 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 835 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  35.29 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 814 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 740 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  46.03 
 
 		 833 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 857 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 827 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 743 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 726 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 797 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 741 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1555  heavy metal transport/detoxification protein  40.62 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0613  heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 830 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 807 aa  52  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 762 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 767 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 762 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 832 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 711 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 827 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  41.38 
 
 		 826 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 841 aa  51.2  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A04  copper chaperone  37.31 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 824 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2344  heavy metal transport/detoxification protein  39.71 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177246  normal  0.640868 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 721 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 824 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 832 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 824 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 882 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 802 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 926 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  46.55 
 
 		 724 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 734 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  32.35 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  39.34 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 1182 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 751 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 852 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0294  Heavy metal transport/detoxification protein  38.81 
 
 		 65 aa  48.9  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3893  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 855 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0676601  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.74 
 
 		 786 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1381  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 844 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0131  Heavy metal transport/detoxification protein  39.39 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4897  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 827 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.248025  normal  0.348601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  33.33 
 
 		 811 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  42.11 
 
 		 851 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 840 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6893  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 872 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.172746  normal  0.265411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 774 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2539  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 838 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.687698  normal  0.311305 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 795 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.31 
 
 		 833 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  37.88 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1164  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 719 aa  47.4  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  33.33 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 826 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 795 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 818 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 814 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 793 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.32 
 
 		 768 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  42.19 
 
 		 826 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  33.87 
 
 		 142 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 		 861 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1645  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 964 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.029405  hitchhiker  0.00127131 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1536  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 		 813 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.627747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 720 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4520  heavy metal transport/detoxification protein  35.29 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  30.3 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 825 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  30.3 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 712 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>