141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1427 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 78 aa  156  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  68 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  47.22 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A04  copper chaperone  46.05 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  33.85 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  37.7 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  33.82 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  35.29 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  33.33 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0354  copper chaperone  45.61 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000813596  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  28.21 
 
 		 752 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2900  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 795 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0179481  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 889 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18380  copper chaperone  35.48 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04940  copper chaperone  35.48 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 709 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 889 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 806 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 750 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  28.12 
 
 		 471 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  29.03 
 
 		 806 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 795 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  29.03 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  25.76 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 740 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  35.06 
 
 		 723 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0413  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 723 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 731 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  27.42 
 
 		 806 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  27.42 
 
 		 806 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 828 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 825 aa  45.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  27.69 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05930  hypothetical protein  42.42 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.720927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1872  heavy metal transport/detoxification protein  29.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230412  unclonable  0.0000667879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 849 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  27.63 
 
 		 904 aa  44.7  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 785 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 758 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4022  Heavy metal transport/detoxification protein  32 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.375951 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1638  putative MerP, periplasmic heavy metal binding/chaperone protein  29.51 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.240185  hitchhiker  0.000119681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  28.12 
 
 		 713 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1968  heavy metal transport/detoxification protein  30.43 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.563068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  27.87 
 
 		 740 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  28.77 
 
 		 802 aa  43.9  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  29.31 
 
 		 732 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 794 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3789  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 		 836 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0366996  normal  0.767636 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4065  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 		 836 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  28.79 
 
 		 499 aa  43.5  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  31.34 
 
 		 784 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  27.27 
 
 		 759 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 		 942 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 818 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  28.79 
 
 		 803 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 894 aa  42.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  31.67 
 
 		 560 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 797 aa  42.7  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  29.23 
 
 		 721 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  26.47 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00435  copper transporter  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3126  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  32.79 
 
 		 735 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  30 
 
 		 1071 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 797 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0563  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0523  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  29.41 
 
 		 771 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  31.34 
 
 		 787 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3132  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142794  hitchhiker  0.000000556714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0527  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0419  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0577  copper exporting ATPase  31.25 
 
 		 834 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  27.87 
 
 		 731 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  32.76 
 
 		 694 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  25.37 
 
 		 861 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 734 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  25.81 
 
 		 551 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  27.94 
 
 		 844 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  29.31 
 
 		 806 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>