More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2086 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
713 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.5 
 
 
709 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  46.92 
 
 
707 aa  639    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  50.07 
 
 
712 aa  698    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  51.36 
 
 
783 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  100 
 
 
735 aa  1462    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  50.21 
 
 
712 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  50.91 
 
 
712 aa  707    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
833 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  43.67 
 
 
767 aa  621  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  44.56 
 
 
751 aa  605  9.999999999999999e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  46.83 
 
 
673 aa  553  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
726 aa  547  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
785 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  45.48 
 
 
635 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.59 
 
 
825 aa  543  1e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
800 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  43.16 
 
 
800 aa  540  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
939 aa  542  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  40.19 
 
 
750 aa  538  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.68 
 
 
738 aa  538  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  39.82 
 
 
812 aa  537  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
737 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  43.04 
 
 
713 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  41.51 
 
 
769 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  40.95 
 
 
748 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
734 aa  532  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
984 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 
984 aa  531  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
750 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
800 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  40.72 
 
 
1022 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
800 aa  527  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  43.57 
 
 
734 aa  527  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 
799 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  41.17 
 
 
750 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
752 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
868 aa  525  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
926 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 
711 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  41.03 
 
 
750 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
800 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
904 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 
791 aa  515  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
799 aa  515  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  42.32 
 
 
711 aa  512  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.34 
 
 
752 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
738 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  47.41 
 
 
801 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
750 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 
712 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.69 
 
 
734 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  45.15 
 
 
800 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  41.81 
 
 
794 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
728 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
728 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
748 aa  499  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  40.2 
 
 
712 aa  498  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 
718 aa  497  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 
726 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  42.83 
 
 
637 aa  498  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 
640 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.37 
 
 
793 aa  494  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  41.08 
 
 
742 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  40.23 
 
 
709 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.66 
 
 
773 aa  488  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  44.64 
 
 
830 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  41.76 
 
 
799 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  41.16 
 
 
720 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
734 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  46.76 
 
 
972 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 
850 aa  485  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
744 aa  485  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  39.94 
 
 
814 aa  480  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0397  heavy metal-transporting ATPase  39.75 
 
 
641 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0178655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
832 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  45.06 
 
 
713 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.08 
 
 
743 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  44.89 
 
 
713 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0410  heavy metal-transporting ATPase  39.75 
 
 
641 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
834 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 
722 aa  482  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0525  heavy metal-transporting ATPase  39.9 
 
 
641 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0455  heavy metal-transporting ATPase  39.69 
 
 
641 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  45.18 
 
 
832 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  44.91 
 
 
834 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2691  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
677 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000392572  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0390  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 
641 aa  480  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0043971  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0524  heavy metal-transporting ATPase  39.75 
 
 
641 aa  479  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3367  heavy metal translocating P-type ATPase  42.73 
 
 
809 aa  477  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0385  cation-transporting ATPase, P-type  39.59 
 
 
641 aa  476  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.415078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  38.23 
 
 
740 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
785 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  40.03 
 
 
768 aa  478  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.49 
 
 
709 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.59 
 
 
711 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4435  heavy metal translocating P-type ATPase  44.51 
 
 
833 aa  478  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  39.97 
 
 
704 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  44.56 
 
 
828 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0135  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 
723 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.234448  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>