More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3683 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  64.62 
 
 
750 aa  915    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  61.99 
 
 
800 aa  942    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  67.87 
 
 
972 aa  880    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  63.88 
 
 
734 aa  859    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  64.9 
 
 
750 aa  918    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  63.83 
 
 
752 aa  904    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  61.4 
 
 
796 aa  785    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  62.66 
 
 
785 aa  812    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  68.62 
 
 
800 aa  934    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  64.76 
 
 
701 aa  875    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  67.53 
 
 
800 aa  904    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  61.99 
 
 
800 aa  942    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  64.48 
 
 
750 aa  906    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
713 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  50.5 
 
 
711 aa  680    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  50.07 
 
 
713 aa  675    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64.2 
 
 
752 aa  888    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64.44 
 
 
743 aa  839    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  56.35 
 
 
739 aa  720    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  63.76 
 
 
856 aa  832    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64.91 
 
 
783 aa  842    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  68.62 
 
 
800 aa  934    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
828 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  60.62 
 
 
713 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  66.23 
 
 
769 aa  902    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  63.66 
 
 
866 aa  825    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  64.81 
 
 
748 aa  871    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  57.77 
 
 
939 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  63.07 
 
 
800 aa  943    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  66.09 
 
 
750 aa  894    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  61.23 
 
 
830 aa  815    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  60.11 
 
 
812 aa  773    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  60.47 
 
 
748 aa  818    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  62.76 
 
 
709 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  63.75 
 
 
848 aa  828    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  68.35 
 
 
799 aa  949    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  69.64 
 
 
799 aa  914    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  67.87 
 
 
984 aa  932    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  65.34 
 
 
794 aa  864    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
834 aa  799    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  67.87 
 
 
984 aa  932    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  63.61 
 
 
846 aa  817    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  64.3 
 
 
726 aa  903    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
832 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  62.6 
 
 
801 aa  904    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  64.84 
 
 
704 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  65.38 
 
 
742 aa  864    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
832 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  60.76 
 
 
834 aa  799    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  63.61 
 
 
846 aa  817    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
791 aa  1600    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
762 aa  677    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  65.12 
 
 
712 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  54.79 
 
 
745 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  64.48 
 
 
862 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  69.5 
 
 
799 aa  936    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  53.95 
 
 
753 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  53.11 
 
 
783 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  50.77 
 
 
784 aa  612  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  50.91 
 
 
783 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  50.91 
 
 
783 aa  607  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  57.74 
 
 
629 aa  595  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  50.72 
 
 
732 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 
783 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 
712 aa  546  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 
712 aa  548  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 
712 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
767 aa  535  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  42.47 
 
 
713 aa  532  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  43.72 
 
 
833 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  42.49 
 
 
1022 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  51.33 
 
 
673 aa  526  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  46.62 
 
 
673 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  42.44 
 
 
737 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  43.58 
 
 
707 aa  524  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  40.89 
 
 
709 aa  522  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  51 
 
 
673 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
868 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  41.89 
 
 
735 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  38.62 
 
 
793 aa  495  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
728 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
728 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
751 aa  489  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  46.08 
 
 
718 aa  488  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
726 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 
734 aa  481  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.08 
 
 
904 aa  480  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  45.3 
 
 
738 aa  472  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 
712 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  38.45 
 
 
738 aa  475  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 
814 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
926 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 
740 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.03 
 
 
785 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  38.13 
 
 
740 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
812 aa  466  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
802 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  45.34 
 
 
734 aa  460  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
825 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 
844 aa  461  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>