More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0114 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  69.02 
 
 		 748 aa  887    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  69.26 
 
 		 750 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  69.26 
 
 		 734 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  69.84 
 
 		 750 aa  924    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  68.88 
 
 		 752 aa  932    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  70.42 
 
 		 750 aa  947    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  69.41 
 
 		 750 aa  931    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  74.82 
 
 		 701 aa  1023    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  81.7 
 
 		 713 aa  1080    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  51.36 
 
 		 711 aa  672    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  52.49 
 
 		 713 aa  693    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  68.73 
 
 		 752 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  68.64 
 
 		 743 aa  882    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  58.56 
 
 		 739 aa  753    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  68.65 
 
 		 783 aa  872    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  81.7 
 
 		 832 aa  1078    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  68.5 
 
 		 800 aa  882    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  81.42 
 
 		 713 aa  1075    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  67.97 
 
 		 769 aa  904    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  93.18 
 
 		 866 aa  1226    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  68.78 
 
 		 800 aa  929    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  69.87 
 
 		 800 aa  943    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  80.85 
 
 		 830 aa  1073    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  98.58 
 
 		 856 aa  1380    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  61.35 
 
 		 812 aa  779    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  60.23 
 
 		 748 aa  804    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  74.82 
 
 		 709 aa  1000    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  69.87 
 
 		 800 aa  943    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  68.44 
 
 		 972 aa  852    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  69.6 
 
 		 799 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  68.44 
 
 		 984 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  66.52 
 
 		 794 aa  873    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  69.97 
 
 		 799 aa  932    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  92.76 
 
 		 846 aa  1187    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  89.79 
 
 		 862 aa  1164    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  57.77 
 
 		 939 aa  748    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  70.94 
 
 		 800 aa  941    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  68.35 
 
 		 801 aa  883    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 704 aa  1401    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  69.6 
 
 		 742 aa  877    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  68.78 
 
 		 800 aa  929    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  92.76 
 
 		 846 aa  1187    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  65.42 
 
 		 791 aa  860    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  55.99 
 
 		 762 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  67.97 
 
 		 712 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  81.7 
 
 		 834 aa  1079    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  66.33 
 
 		 796 aa  822    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  62.73 
 
 		 726 aa  870    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  81.13 
 
 		 828 aa  1072    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  68.64 
 
 		 785 aa  867    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  57.34 
 
 		 745 aa  684    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  69.35 
 
 		 799 aa  897    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  53.41 
 
 		 753 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  92.9 
 
 		 848 aa  1216    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  81.7 
 
 		 834 aa  1079    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  81.7 
 
 		 832 aa  1079    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  68.44 
 
 		 984 aa  895    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  53.5 
 
 		 783 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  52.82 
 
 		 784 aa  592  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  55.65 
 
 		 629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  53.64 
 
 		 732 aa  571  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 		 783 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  52.33 
 
 		 783 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 		 783 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  50.84 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  44.46 
 
 		 1022 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 833 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  45.5 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  45.5 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.33 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 		 673 aa  512  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  47.74 
 
 		 707 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.16 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 737 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  45.2 
 
 		 767 aa  504  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.29 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  46.88 
 
 		 718 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 		 785 aa  479  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 734 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  44.74 
 
 		 868 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  40.86 
 
 		 812 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 728 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 738 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 728 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  44.31 
 
 		 751 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.31 
 
 		 793 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  42.05 
 
 		 825 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 		 904 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  43.61 
 
 		 926 aa  449  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  43.38 
 
 		 735 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  40.83 
 
 		 709 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.17 
 
 		 740 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 		 740 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 844 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  41.37 
 
 		 768 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2481  heavy metal translocating P-type ATPase  46.86 
 
 		 802 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.429438  normal  0.100941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 		 750 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 955 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>