More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1677 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  67.86 
 
 
984 aa  928    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  63.12 
 
 
750 aa  907    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  61.16 
 
 
848 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  71.04 
 
 
800 aa  997    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  63.14 
 
 
752 aa  912    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  64.98 
 
 
712 aa  920    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  64.85 
 
 
800 aa  941    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  64.32 
 
 
800 aa  921    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  60.82 
 
 
785 aa  820    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  63.46 
 
 
750 aa  896    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  63.79 
 
 
734 aa  867    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
713 aa  811    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  50.28 
 
 
711 aa  685    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  51.63 
 
 
713 aa  699    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  62.93 
 
 
752 aa  887    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  64 
 
 
743 aa  842    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  53.47 
 
 
739 aa  726    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  63.2 
 
 
783 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  64.85 
 
 
800 aa  941    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  60.03 
 
 
713 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  64.2 
 
 
769 aa  911    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  67.62 
 
 
972 aa  877    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  61.02 
 
 
866 aa  848    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  66.76 
 
 
701 aa  897    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  63.21 
 
 
750 aa  905    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  61.09 
 
 
856 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
834 aa  811    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  60.16 
 
 
796 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  59.73 
 
 
830 aa  830    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  58.57 
 
 
812 aa  777    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  61.22 
 
 
748 aa  863    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  65.01 
 
 
709 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  64.74 
 
 
799 aa  922    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  67.05 
 
 
799 aa  902    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  67.86 
 
 
984 aa  928    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  62.74 
 
 
794 aa  866    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  60.74 
 
 
846 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
832 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  57.88 
 
 
939 aa  790    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  66.28 
 
 
801 aa  884    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  62.01 
 
 
704 aa  816    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  63.7 
 
 
742 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  52.55 
 
 
762 aa  718    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
726 aa  1472    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  60.74 
 
 
846 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  64.3 
 
 
791 aa  889    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  65.37 
 
 
800 aa  878    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  62.05 
 
 
862 aa  810    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  63.26 
 
 
750 aa  906    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
832 aa  811    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
828 aa  812    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  60.17 
 
 
834 aa  811    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  71.04 
 
 
800 aa  997    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  63.41 
 
 
748 aa  845    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  53.19 
 
 
745 aa  692    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 
799 aa  920    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  52.17 
 
 
753 aa  679    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
783 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 
712 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  45.33 
 
 
712 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  46.98 
 
 
784 aa  580  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  45.22 
 
 
712 aa  581  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  52.67 
 
 
629 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
783 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  43.58 
 
 
783 aa  572  1e-161  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 
783 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.85 
 
 
709 aa  553  1e-156  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  49.29 
 
 
732 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  49.24 
 
 
673 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  43.88 
 
 
713 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 
833 aa  532  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
1022 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 
673 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 
707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 
737 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
767 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  51.43 
 
 
673 aa  515  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  41.05 
 
 
735 aa  512  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 
785 aa  497  1e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
868 aa  492  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  39.09 
 
 
718 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  40.28 
 
 
734 aa  485  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  44.43 
 
 
751 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  38.52 
 
 
812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
712 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.58 
 
 
825 aa  464  1e-129  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
728 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 
728 aa  463  1e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  40.82 
 
 
711 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  38.96 
 
 
793 aa  459  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  39.42 
 
 
709 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  37.95 
 
 
734 aa  457  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  38.25 
 
 
844 aa  458  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
926 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  36.81 
 
 
904 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  42.93 
 
 
678 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  38.06 
 
 
814 aa  450  1e-125  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 
726 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
738 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
720 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>