More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3643 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3501  heavy metal translocating P-type ATPase  65.03 
 
 		 758 aa  896    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.968413 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  53.07 
 
 		 740 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3338  heavy metal translocating P-type ATPase  66.85 
 
 		 759 aa  860    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.837764  normal  0.51996 
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  66.48 
 
 		 814 aa  907    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3796  heavy metal translocating P-type ATPase  65.56 
 
 		 756 aa  910    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  54.67 
 
 		 718 aa  697    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  54.91 
 
 		 731 aa  672    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3679  heavy metal translocating P-type ATPase  51.73 
 
 		 709 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  55.22 
 
 		 712 aa  730    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  53.07 
 
 		 740 aa  696    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0269  heavy metal translocating P-type ATPase  52.29 
 
 		 713 aa  669    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1027  (Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  56.48 
 
 		 777 aa  695    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  53.2 
 
 		 904 aa  711    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  66.53 
 
 		 744 aa  904    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  70.53 
 
 		 716 aa  947    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 726 aa  1436    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4535  heavy metal translocating P-type ATPase  76.42 
 
 		 734 aa  1059    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  54.17 
 
 		 711 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  50.61 
 
 		 738 aa  687    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  50.76 
 
 		 793 aa  679    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  52.75 
 
 		 722 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3411  hypothetical protein  52.56 
 
 		 803 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  62.72 
 
 		 955 aa  848    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  55.36 
 
 		 731 aa  678    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  61.73 
 
 		 734 aa  840    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  68.97 
 
 		 764 aa  957    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3978  heavy metal translocating P-type ATPase  66.94 
 
 		 759 aa  859    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39503  normal  0.602002 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  68.1 
 
 		 844 aa  925    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7259  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  78.5 
 
 		 678 aa  1021    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.482594 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  66.34 
 
 		 704 aa  895    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  63.26 
 
 		 757 aa  849    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  51.6 
 
 		 758 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2344  heavy metal translocating P-type ATPase  52.36 
 
 		 732 aa  652    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.442895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  53.82 
 
 		 720 aa  710    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4071  heavy metal translocating P-type ATPase  62.59 
 
 		 712 aa  815    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.515155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3467  heavy metal translocating P-type ATPase  55.25 
 
 		 634 aa  618  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.81 
 
 		 773 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004007  copper-translocating P-type ATPase  46.22 
 
 		 768 aa  604  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01515  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.62 
 
 		 689 aa  582  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3873  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  47.11 
 
 		 728 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0472181  normal  0.24383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1611  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.4 
 
 		 803 aa  572  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.730441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3768  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.14 
 
 		 732 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3948  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.01 
 
 		 732 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0551  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.39 
 
 		 768 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.34 
 
 		 771 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3845  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.01 
 
 		 732 aa  552  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03318  zinc, cobalt and lead efflux system  45.39 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4789  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.39 
 
 		 732 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3888  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.87 
 
 		 732 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3778  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  46.13 
 
 		 732 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03271  hypothetical protein  45.39 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3752  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.53 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3951  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.39 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3668  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.25 
 
 		 732 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0246  heavy metal translocating P-type ATPase  45.12 
 
 		 732 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0247  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.53 
 
 		 732 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3853  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  45.12 
 
 		 732 aa  545  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0088  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.73 
 
 		 784 aa  542  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.473574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0093  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  50.77 
 
 		 787 aa  537  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 		 712 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.86 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.6 
 
 		 782 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.32 
 
 		 782 aa  512  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  44.09 
 
 		 788 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.05 
 
 		 709 aa  503  1e-141  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 673 aa  500  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  41.33 
 
 		 707 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  40.33 
 
 		 783 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 		 767 aa  488  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 800 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  40.03 
 
 		 800 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  39.42 
 
 		 750 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  39.17 
 
 		 752 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 750 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  40.38 
 
 		 799 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  39.42 
 
 		 750 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  41.11 
 
 		 701 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  39.61 
 
 		 791 aa  480  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  40.06 
 
 		 735 aa  477  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  41.36 
 
 		 734 aa  476  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.22 
 
 		 713 aa  475  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  39.23 
 
 		 750 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.01 
 
 		 984 aa  472  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  39.01 
 
 		 984 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  37.89 
 
 		 769 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 833 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.48 
 
 		 800 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  39.59 
 
 		 800 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  39.59 
 
 		 800 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 748 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 939 aa  468  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  40.19 
 
 		 748 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 734 aa  463  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 750 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  37.59 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  37.79 
 
 		 713 aa  460  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  39.89 
 
 		 712 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.15 
 
 		 709 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 799 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>