More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2147 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 713 aa  1432    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  54.96 
 
 		 709 aa  729    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  51.36 
 
 		 707 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  54.05 
 
 		 712 aa  760    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  54.62 
 
 		 712 aa  760    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  48.94 
 
 		 735 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  49.72 
 
 		 783 aa  681    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  54.48 
 
 		 712 aa  760    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  45.88 
 
 		 833 aa  623  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  44.36 
 
 		 767 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  47.2 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  47.2 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 		 939 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  46.61 
 
 		 799 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 750 aa  555  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  48.06 
 
 		 800 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  47.08 
 
 		 800 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  47.08 
 
 		 800 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  48.06 
 
 		 800 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  41.81 
 
 		 785 aa  556  1e-157  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  48.9 
 
 		 752 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  43.88 
 
 		 726 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  47.04 
 
 		 734 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  46.32 
 
 		 750 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  44.19 
 
 		 799 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  41.65 
 
 		 825 aa  549  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  47.08 
 
 		 800 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  49.14 
 
 		 750 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  48.99 
 
 		 769 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 		 1022 aa  548  1e-154  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  50.09 
 
 		 801 aa  545  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  48.12 
 
 		 750 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  44.7 
 
 		 734 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  46.3 
 
 		 738 aa  545  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 737 aa  543  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  49.58 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  43.71 
 
 		 713 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  49.4 
 
 		 800 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 		 972 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  43.78 
 
 		 748 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  42.22 
 
 		 812 aa  537  1e-151  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  49.15 
 
 		 748 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2242  heavy metal translocating P-type ATPase  44.13 
 
 		 750 aa  534  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 868 aa  533  1e-150  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 791 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  44.06 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.89 
 
 		 739 aa  529  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  48.55 
 
 		 830 aa  529  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  43.44 
 
 		 794 aa  531  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  44.07 
 
 		 742 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  49.07 
 
 		 752 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  47.88 
 
 		 799 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  47.35 
 
 		 743 aa  522  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 926 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  47.39 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 713 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  42.7 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  46.18 
 
 		 751 aa  519  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 713 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0209  heavy metal translocating P-type ATPase  45.56 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.454108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 834 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 832 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 828 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 834 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  47.19 
 
 		 832 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 866 aa  515  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 		 785 aa  511  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  42.9 
 
 		 734 aa  510  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  43.04 
 
 		 848 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 783 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2637  heavy metal translocating P-type ATPase  44.77 
 
 		 637 aa  505  1e-141  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.630665  hitchhiker  0.00871395 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  47.3 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3134  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 		 712 aa  496  1e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  40.16 
 
 		 738 aa  496  1e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 728 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 728 aa  497  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  46.76 
 
 		 812 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  44.65 
 
 		 796 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  47.23 
 
 		 856 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  47.99 
 
 		 862 aa  491  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  46.72 
 
 		 704 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0894  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000637035 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.63 
 
 		 850 aa  488  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  40.27 
 
 		 740 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  40.57 
 
 		 904 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  40.81 
 
 		 793 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  42.25 
 
 		 814 aa  485  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 740 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3336  heavy metal translocating P-type ATPase  41.49 
 
 		 744 aa  482  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812406 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 704 aa  482  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  46.21 
 
 		 745 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  46.1 
 
 		 753 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7421  lead, cadmium, zinc and mercury-transporting ATPase  39.05 
 
 		 764 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.396456 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3208  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 		 720 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1505  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 		 716 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.724781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3643  heavy metal translocating P-type ATPase  40.22 
 
 		 726 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.545825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>