More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05448 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1677  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 726 aa  639    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  51.18 
 
 		 750 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05448  metal-transporting P-type ATPase transmembrane protein  100 
 
 		 784 aa  1513    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.481945  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  52.01 
 
 		 750 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  52.66 
 
 		 748 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  52.07 
 
 		 800 aa  691    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  48.66 
 
 		 752 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 984 aa  671    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.08 
 
 		 752 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  49.3 
 
 		 769 aa  685    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  53.54 
 
 		 812 aa  672    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2550  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 		 748 aa  670    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  52.09 
 
 		 800 aa  656    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5947  Pb(II) resistance ATPase PbrA  53.14 
 
 		 799 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 984 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  52.14 
 
 		 794 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 800 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 		 939 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  51.25 
 
 		 801 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  51.95 
 
 		 742 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  52.07 
 
 		 800 aa  691    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4809  heavy metal translocating P-type ATPase  84.44 
 
 		 783 aa  1075    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159985  normal  0.383741 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3732  heavy metal translocating P-type ATPase  84.44 
 
 		 783 aa  1075    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  51.19 
 
 		 791 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0832  heavy metal translocating P-type ATPase  53.9 
 
 		 783 aa  686    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 750 aa  675    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 		 734 aa  656    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  51.73 
 
 		 800 aa  682    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  51.18 
 
 		 750 aa  667    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  52.22 
 
 		 799 aa  687    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  51.37 
 
 		 800 aa  667    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1242  heavy metal translocating P-type ATPase  52.57 
 
 		 799 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  53.36 
 
 		 712 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  50.42 
 
 		 701 aa  634  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2148  heavy metal translocating P-type ATPase  51.32 
 
 		 972 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.235605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3972  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  50.25 
 
 		 783 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  51.93 
 
 		 866 aa  621  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 848 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  52.07 
 
 		 856 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  49.58 
 
 		 709 aa  612  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2257  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.56 
 
 		 743 aa  606  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  48.61 
 
 		 830 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  48.41 
 
 		 834 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  48.77 
 
 		 828 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  52.34 
 
 		 846 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  52.34 
 
 		 846 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  48.53 
 
 		 832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  48.41 
 
 		 834 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1049  hypothetical protein  44.99 
 
 		 713 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 713 aa  598  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  51.72 
 
 		 713 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  51.84 
 
 		 704 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0123  heavy metal translocating P-type ATPase  52.31 
 
 		 862 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3564  heavy metal translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 785 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2370  hypothetical protein  44.21 
 
 		 711 aa  578  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  47.12 
 
 		 796 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00827087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  47.58 
 
 		 745 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1335  heavy metal translocating P-type ATPase  47.42 
 
 		 753 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333183  normal  0.209936 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  46.46 
 
 		 739 aa  560  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3562  heavy metal translocating P-type ATPase  48.24 
 
 		 762 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482767  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  54.51 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.115559  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 		 737 aa  479  1e-134  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2915  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 		 732 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.522074  normal  0.0959019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37.63 
 
 		 783 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  42.55 
 
 		 1022 aa  467  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  45.8 
 
 		 673 aa  467  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 712 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 		 712 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  40.46 
 
 		 713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  38.94 
 
 		 712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.22 
 
 		 833 aa  450  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  41.95 
 
 		 707 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 		 767 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1151  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 904 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0071597  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.23 
 
 		 709 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2594  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 		 673 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.037296  normal  0.268336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1214  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 		 673 aa  432  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1627  heavy metal translocating P-type ATPase  43.82 
 
 		 718 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 786 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3947  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 728 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3609  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 728 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.545051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1096  heavy metal translocating P-type ATPase  41.55 
 
 		 731 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4117  heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 731 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.194383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 		 844 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2581  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 793 aa  411  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 		 738 aa  412  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 		 751 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2066  heavy metal translocating P-type ATPase  45.21 
 
 		 838 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 		 738 aa  409  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2067  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  40.58 
 
 		 773 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5561  P type cation (metal) transporter ATPase component  43.2 
 
 		 757 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.85793  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1791  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  43.46 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2752  heavy metal translocating P-type ATPase  44.35 
 
 		 722 aa  405  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  41.39 
 
 		 734 aa  403  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0209  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  36.84 
 
 		 771 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0277781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 786 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0438  heavy metal translocating P-type ATPase  43.46 
 
 		 740 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  35.58 
 
 		 707 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>