More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1802 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 71 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  60 
 
 		 72 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  55.07 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  49.28 
 
 		 78 aa  80.1  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  54.69 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  49.28 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 77 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  41.18 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  45 
 
 		 826 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 		 836 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 814 aa  61.6  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  44.78 
 
 		 824 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 838 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  39.34 
 
 		 742 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  41.27 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 839 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  38.33 
 
 		 837 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  40 
 
 		 833 aa  56.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 711 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 783 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 797 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  47.37 
 
 		 758 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.31 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 795 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  43.08 
 
 		 827 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  46.43 
 
 		 832 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 868 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 811 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 942 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 811 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 832 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  35.82 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 1071 aa  53.9  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 826 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 887 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 818 aa  52.8  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 740 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0080  heavy metal transport/detoxification protein  40 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 825 aa  52.4  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.338501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 866 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 824 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 871 aa  52  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1164  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 719 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 821 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 885 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2770  protein of unknown function DUF182  41.79 
 
 		 345 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  42.37 
 
 		 724 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 837 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0521  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 807 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0113  mercuric transport protein periplasmic component  37.5 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3584  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 		 805 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3653  heavy metal translocating P-type ATPase  35.09 
 
 		 805 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3496  copper-translocating P-type ATPase  35.09 
 
 		 805 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 		 837 aa  51.6  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 806 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 806 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  38.1 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 812 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  41.18 
 
 		 765 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2185  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 754 aa  51.2  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  28.57 
 
 		 78 aa  50.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 831 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 857 aa  50.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 835 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 760 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3641  heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 837 aa  50.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1095  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 751 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 851 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 806 aa  50.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7843  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 835 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  37.1 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  41.67 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 830 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  45.76 
 
 		 739 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  38.46 
 
 		 748 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1338  heavy metal-binding domain-containing protein  36.92 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  35 
 
 		 740 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 741 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  42.11 
 
 		 750 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 836 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  40.62 
 
 		 751 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3167  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  39.34 
 
 		 817 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 739 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  27.69 
 
 		 836 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  36.92 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1661  heavy metal translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 825 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119959  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  32.2 
 
 		 802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.2 
 
 		 802 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>