More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2479 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  57.16 
 
 
805 aa  775    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  51.83 
 
 
813 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  54.43 
 
 
775 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  52.52 
 
 
802 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  100 
 
 
765 aa  1478    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
777 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  52.72 
 
 
824 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  54.37 
 
 
830 aa  621  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  53.31 
 
 
817 aa  619  1e-176  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  54.66 
 
 
760 aa  619  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  52.15 
 
 
795 aa  618  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.57 
 
 
812 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  44.93 
 
 
839 aa  535  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 
846 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 
838 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
847 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  43.92 
 
 
834 aa  495  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  45.28 
 
 
861 aa  490  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.62 
 
 
847 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.97 
 
 
799 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
803 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
803 aa  481  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
849 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
803 aa  475  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  45.76 
 
 
851 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  39.59 
 
 
794 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.22 
 
 
807 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 
815 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  35.76 
 
 
799 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  36.82 
 
 
799 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 
799 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  42.08 
 
 
811 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
799 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
799 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 
794 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 
806 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  41.36 
 
 
811 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.38 
 
 
790 aa  457  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
799 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.96 
 
 
795 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 
824 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
811 aa  451  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  42.92 
 
 
882 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 
824 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 
813 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  34.99 
 
 
791 aa  446  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
824 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.91 
 
 
819 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
787 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  35.93 
 
 
791 aa  437  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
802 aa  439  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  43.39 
 
 
800 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 
810 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.75 
 
 
802 aa  436  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 
797 aa  435  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.91 
 
 
787 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  42.3 
 
 
816 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  36.34 
 
 
792 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  34.4 
 
 
796 aa  428  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.16 
 
 
826 aa  429  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  41.6 
 
 
814 aa  426  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
792 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.11 
 
 
820 aa  420  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  34.19 
 
 
828 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
743 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  40.14 
 
 
737 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
818 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  39.2 
 
 
732 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 
808 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  40.36 
 
 
737 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  40.58 
 
 
737 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
814 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
707 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.74 
 
 
802 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  37.22 
 
 
762 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.74 
 
 
802 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  29.77 
 
 
806 aa  378  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  39.91 
 
 
648 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
755 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.57 
 
 
807 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  38.5 
 
 
727 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  37.17 
 
 
728 aa  373  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
738 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.83 
 
 
793 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.81 
 
 
797 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 
798 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  30.47 
 
 
797 aa  367  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
731 aa  365  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
752 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  34.61 
 
 
761 aa  363  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  35.12 
 
 
731 aa  363  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 
809 aa  363  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  35.01 
 
 
732 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.29 
 
 
805 aa  362  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
740 aa  362  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  34.29 
 
 
752 aa  359  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.73 
 
 
817 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
809 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  33.72 
 
 
826 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>