More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1663 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 77 aa  153  9e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  60.26 
 
 		 78 aa  99.4  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  60 
 
 		 76 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  70.67 
 
 		 76 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  56.76 
 
 		 75 aa  85.1  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  57.35 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 72 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 79 aa  68.6  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  47.62 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0593  heavy metal translocating P-type ATPase  47.76 
 
 		 711 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.483135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 		 751 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  44.93 
 
 		 824 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 835 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  43.66 
 
 		 836 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0133  ATPase, P type cation/copper-transporter  37.1 
 
 		 751 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  47.46 
 
 		 762 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 826 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  35.38 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  37.88 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 707 aa  53.9  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5373  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 937 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4827  heavy metal translocating P-type ATPase  42.37 
 
 		 946 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0162  copper-translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 793 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 743 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.43 
 
 		 817 aa  52  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 799 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 799 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 754 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 763 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0212  copper-translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 759 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5366  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.475647  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5494  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 1021 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0117323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 813 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  45.16 
 
 		 840 aa  50.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 783 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 827 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 800 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 		 799 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 737 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 748 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 737 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  41.54 
 
 		 1087 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3299  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 1182 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741237  normal  0.115962 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 936 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  41.43 
 
 		 816 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  31.34 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 737 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 		 868 aa  50.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2086  cadmium-transporting ATPase  34.43 
 
 		 735 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 841 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 737 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3742  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000142681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0316  cation-transporting ATPase membrane protein  40.98 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.707407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3759  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.206021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 750 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0405  cation-transporting ATPase membrane protein  40.98 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3576  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000264411  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1144  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1851  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.845444  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1755  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 797 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3860  copper-ion-binding protein  38.1 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00109748  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4129  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 955 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594841  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 821 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  36.99 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 785 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0854  copper-translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 1061 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4777  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 1013 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.701128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  38.67 
 
 		 750 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  39.29 
 
 		 826 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 827 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  40.98 
 
 		 794 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 750 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 764 aa  47.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  44.83 
 
 		 795 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 765 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 752 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 810 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 801 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0698  copper ion binding protein  41.82 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.031698  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  34.43 
 
 		 68 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 868 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  39.34 
 
 		 792 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  39.34 
 
 		 792 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  44.26 
 
 		 833 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 782 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2168  copper-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 971 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 841 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  36.07 
 
 		 67 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  36.67 
 
 		 551 aa  47  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 782 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  41.82 
 
 		 782 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>