More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2618 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  54.19 
 
 
752 aa  693    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  52.25 
 
 
751 aa  654    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  54.76 
 
 
761 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
754 aa  1489    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  50.67 
 
 
746 aa  632  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.94 
 
 
755 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  47.61 
 
 
766 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  48.13 
 
 
761 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  48.05 
 
 
757 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  49.93 
 
 
792 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
733 aa  608  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
769 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  49.73 
 
 
739 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  49.27 
 
 
750 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  49.28 
 
 
760 aa  594  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  50.07 
 
 
745 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
782 aa  589  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  48.99 
 
 
782 aa  590  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.13 
 
 
782 aa  591  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  49.4 
 
 
765 aa  587  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  50.41 
 
 
769 aa  582  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  49.53 
 
 
749 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  49.39 
 
 
745 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  47.4 
 
 
760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  47.4 
 
 
760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
785 aa  575  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  47.98 
 
 
785 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  50.47 
 
 
752 aa  566  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  46.26 
 
 
867 aa  568  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
737 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
737 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
737 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  51.01 
 
 
764 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  49 
 
 
762 aa  557  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  49 
 
 
739 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  47.93 
 
 
773 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  49.2 
 
 
764 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  49.4 
 
 
763 aa  552  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  48 
 
 
777 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  47.86 
 
 
768 aa  549  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  49.33 
 
 
737 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  48.26 
 
 
737 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  47.44 
 
 
795 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  46.46 
 
 
758 aa  542  1e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  48.04 
 
 
785 aa  543  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
743 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  49.12 
 
 
764 aa  533  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  43.97 
 
 
779 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  47.21 
 
 
785 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  40.67 
 
 
815 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  41.26 
 
 
753 aa  526  1e-148  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
810 aa  528  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.52 
 
 
805 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
802 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
819 aa  521  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.83 
 
 
798 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
802 aa  520  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.63 
 
 
794 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  39.81 
 
 
805 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  39.49 
 
 
797 aa  512  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  40.87 
 
 
803 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  39.39 
 
 
806 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  39.78 
 
 
805 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  39.81 
 
 
805 aa  511  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.92 
 
 
805 aa  512  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36160  copper/silver-translocating P-type ATPase  41.74 
 
 
847 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735078  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  39.78 
 
 
805 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  39.18 
 
 
750 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  41.11 
 
 
797 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.92 
 
 
805 aa  512  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  39.74 
 
 
752 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
810 aa  507  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
806 aa  505  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
798 aa  502  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2495  copper-translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
759 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.744055  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42.2 
 
 
826 aa  500  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3619  copper-translocating P-type ATPase  37.66 
 
 
759 aa  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 
821 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  40.88 
 
 
798 aa  502  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.53 
 
 
818 aa  496  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
836 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  41.19 
 
 
799 aa  496  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  45.37 
 
 
770 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
759 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  42.01 
 
 
794 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  46.89 
 
 
850 aa  488  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  40.61 
 
 
833 aa  489  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 
838 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
762 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  40.21 
 
 
841 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  46.1 
 
 
792 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
767 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  40.41 
 
 
762 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  45.78 
 
 
868 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  39.61 
 
 
837 aa  484  1e-135  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  41.08 
 
 
817 aa  483  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  42.68 
 
 
793 aa  485  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 
790 aa  480  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.78 
 
 
796 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>