More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0081 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  54.4 
 
 
746 aa  683    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10093  cation transporter ATPase A ctpA  57.65 
 
 
761 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  52.21 
 
 
757 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.66102  normal  0.575194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0912  heavy metal translocating P-type ATPase  52.46 
 
 
766 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5747  heavy metal translocating P-type ATPase  53.56 
 
 
792 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3699  heavy metal-transporting ATPase  54.41 
 
 
745 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0922687 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  52.14 
 
 
755 aa  672    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0081  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
751 aa  1466    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.768822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4550  heavy metal translocating P-type ATPase  52.66 
 
 
761 aa  658    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3948  heavy metal translocating P-type ATPase  53.78 
 
 
737 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  52.52 
 
 
733 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2618  heavy metal translocating P-type ATPase  52.25 
 
 
754 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10104  cation transporter ATPase B ctpB  58.06 
 
 
752 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5305  heavy metal translocating P-type ATPase  53.5 
 
 
782 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.585321  normal  0.36068 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5704  heavy metal translocating P-type ATPase  53.5 
 
 
782 aa  641    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.563796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4022  heavy metal translocating P-type ATPase  53.78 
 
 
737 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217745  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0013  heavy metal translocating P-type ATPase  54.41 
 
 
745 aa  647    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  53.37 
 
 
782 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0968777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3962  heavy metal translocating P-type ATPase  53.78 
 
 
737 aa  640    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0396951 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3670  heavy metal translocating P-type ATPase  50.74 
 
 
769 aa  632  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36740  copper/silver-translocating P-type ATPase  53.28 
 
 
769 aa  625  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.289681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2599  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 
785 aa  625  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.646139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4546  heavy metal translocating P-type ATPase  52.01 
 
 
750 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4589  heavy metal translocating P-type ATPase  48.94 
 
 
867 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4240  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 
785 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8844  heavy metal translocating P-type ATPase  53.17 
 
 
764 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4018  heavy metal translocating P-type ATPase  51.32 
 
 
777 aa  616  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1452  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 
760 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4099  heavy metal translocating P-type ATPase  50.39 
 
 
779 aa  616  1e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1470  heavy metal translocating P-type ATPase  51.06 
 
 
760 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3605  heavy metal translocating P-type ATPase  51.91 
 
 
765 aa  615  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.312774  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1742  heavy metal translocating P-type ATPase  51.32 
 
 
760 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.879703  decreased coverage  0.00498444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1901  heavy metal translocating P-type ATPase  51.49 
 
 
749 aa  608  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2244  heavy metal translocating P-type ATPase  52.23 
 
 
737 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  51.21 
 
 
758 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0781  heavy metal translocating P-type ATPase  51.72 
 
 
773 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.114633  decreased coverage  0.000689318 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0090  heavy metal translocating P-type ATPase  53.08 
 
 
764 aa  601  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4421  copper-translocating P-type ATPase  52.96 
 
 
762 aa  602  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.900391  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6538  heavy metal translocating P-type ATPase  52.41 
 
 
785 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.451318  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2848  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  53.51 
 
 
752 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  48.8 
 
 
850 aa  595  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.888341  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  50.68 
 
 
739 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  51.89 
 
 
795 aa  597  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3788  heavy metal translocating P-type ATPase  50.13 
 
 
785 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4449  heavy metal translocating P-type ATPase  51.88 
 
 
737 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19800  copper/silver-translocating P-type ATPase  50.95 
 
 
768 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.139092  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0536  heavy metal translocating P-type ATPase  52.21 
 
 
764 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.188836  normal  0.0794142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1679  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 
810 aa  572  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238517  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0448  heavy metal translocating P-type ATPase  52.38 
 
 
763 aa  571  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189205  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6798  heavy metal translocating P-type ATPase  51.15 
 
 
739 aa  561  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3873  heavy metal translocating P-type ATPase  50.2 
 
 
770 aa  555  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00658121 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2501  heavy metal translocating P-type ATPase  46.22 
 
 
810 aa  555  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.792891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  44.08 
 
 
819 aa  544  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  39.04 
 
 
805 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 
836 aa  539  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
815 aa  536  1e-151  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 
826 aa  535  1e-150  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
806 aa  531  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  40.43 
 
 
806 aa  531  1e-149  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  39.04 
 
 
805 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  39.04 
 
 
805 aa  528  1e-148  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  38.78 
 
 
805 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  38.91 
 
 
805 aa  523  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  38.78 
 
 
805 aa  524  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  41.69 
 
 
838 aa  522  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  40 
 
 
805 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  42.04 
 
 
837 aa  520  1e-146  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  43.98 
 
 
868 aa  522  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  40.38 
 
 
797 aa  519  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  39.86 
 
 
806 aa  521  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.49 
 
 
794 aa  517  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  48.71 
 
 
792 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  40.43 
 
 
798 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 
841 aa  511  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.736549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  38.61 
 
 
743 aa  510  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
802 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  38.89 
 
 
802 aa  511  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  41.49 
 
 
803 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  40.42 
 
 
753 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  41.25 
 
 
831 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  39.46 
 
 
797 aa  505  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  40.18 
 
 
786 aa  505  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
798 aa  499  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
798 aa  499  1e-140  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  41.24 
 
 
840 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  41.77 
 
 
827 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0406  copper-translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
762 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000369581 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  42.02 
 
 
836 aa  497  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0387  copper-translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
762 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0384  copper-translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
767 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000272293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  41.59 
 
 
814 aa  492  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0392  copper-translocating P-type ATPase  42.34 
 
 
762 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565079  hitchhiker  0.0000000000000025433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
750 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1372  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 
833 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279788  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  42.8 
 
 
831 aa  489  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0447  copper-translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
762 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.93532e-16 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  41.22 
 
 
852 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 
821 aa  492  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
796 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  41.04 
 
 
837 aa  489  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>