180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2338 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2338  Heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  55.7 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  57.58 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1802  heavy metal transport/detoxification protein  55.38 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.125467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  48.05 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3294  heavy metal transport/detoxification protein  48.61 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317102  normal  0.256854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  48.1 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1663  heavy metal transport/detoxification protein  51.52 
 
 		 77 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  41.79 
 
 		 79 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  36.11 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 836 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1043  hypothetical protein  40.3 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000664853  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 942 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 836 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 828 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 		 807 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  33.33 
 
 		 799 aa  50.8  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 835 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 838 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 857 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 839 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0469  heavy metal translocating P-type ATPase  44.64 
 
 		 758 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.472881  normal  0.330055 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 1087 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  35 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  35 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1697  copper ion binding protein  37.88 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1690  copper ion binding protein  36.76 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 800 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  38.46 
 
 		 954 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  31.51 
 
 		 751 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.38 
 
 		 795 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 871 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  38.03 
 
 		 748 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  32.76 
 
 		 837 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  34.38 
 
 		 833 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  31.58 
 
 		 837 aa  46.2  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 811 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0577  heavy metal translocating P-type ATPase  37.88 
 
 		 842 aa  46.2  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.951619  normal  0.619407 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  36.51 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 811 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  34.48 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2454  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 		 824 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000374704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  37.93 
 
 		 811 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 889 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0982  copper chaperone  27.94 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 814 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 750 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 807 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 866 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0441  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 		 827 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.135163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 826 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.48 
 
 		 797 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  30.56 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1652  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 795 aa  45.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0504761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 809 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  36 
 
 		 824 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 753 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 		 818 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  28.12 
 
 		 868 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 889 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A04  copper chaperone  33.33 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1427  heavy metal transport/detoxification protein  27.94 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2084  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 812 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 887 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 832 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  30.77 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 786 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1291  Heavy metal transport/detoxification protein  32.31 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0233  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.6 
 
 		 788 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 840 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 826 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0571  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.6 
 
 		 782 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3985  zinc/cadmium/mercury/lead-transporting ATPase  38.6 
 
 		 782 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 810 aa  44.3  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  30.16 
 
 		 471 aa  44.3  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 802 aa  44.3  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1665  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 774 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000242647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  34.85 
 
 		 795 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 832 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5837  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 733 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 797 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1800  copper ion binding protein  38.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  27.14 
 
 		 794 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  29.23 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 861 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 750 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 798 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 828 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2813  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 830 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3830  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.42331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3780  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000441489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1471  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101941  hitchhiker  0.0000119248 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03624  copper resistance P-type ATPase (Eurofung)  28.79 
 
 		 1182 aa  43.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.102947 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3476  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3488  copper-ion-binding protein  27.94 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000382962  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1467  heavy metal efflux P-type ATPase  27.54 
 
 		 950 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.897361  hitchhiker  0.000055818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 861 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4313  mercuric transport protein periplasmic component  32.81 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 743 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>