More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0451 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.09 
 
 		 847 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  84.2 
 
 		 810 aa  1329    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 811 aa  1645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 		 847 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  43.83 
 
 		 851 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.57 
 
 		 849 aa  620  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  44.84 
 
 		 861 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 812 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  42.7 
 
 		 834 aa  589  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  40.66 
 
 		 839 aa  558  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 		 838 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 		 846 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  41.08 
 
 		 811 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  39.15 
 
 		 806 aa  535  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  40.66 
 
 		 811 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 		 814 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 824 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 		 797 aa  512  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 882 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 807 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 802 aa  511  1e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 		 824 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.04 
 
 		 795 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 794 aa  505  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  39.24 
 
 		 816 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  37.35 
 
 		 791 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  35.84 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.1 
 
 		 799 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.56 
 
 		 790 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.52 
 
 		 803 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.98 
 
 		 803 aa  496  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 		 802 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 819 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.75 
 
 		 799 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 		 799 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.19 
 
 		 824 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 799 aa  485  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  37.12 
 
 		 815 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  39.27 
 
 		 800 aa  481  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 823 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.33 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  35.87 
 
 		 794 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  40.36 
 
 		 765 aa  479  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  36.56 
 
 		 787 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  36.81 
 
 		 787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.18 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  35.83 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  36.33 
 
 		 792 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.78 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  36.37 
 
 		 826 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 		 777 aa  463  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 791 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  33.53 
 
 		 820 aa  456  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.22 
 
 		 792 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 		 775 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  33.17 
 
 		 796 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  38.25 
 
 		 795 aa  429  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.76 
 
 		 818 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 		 760 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  36.77 
 
 		 802 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.37 
 
 		 807 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.01 
 
 		 807 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 		 824 aa  397  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  33.69 
 
 		 807 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  31.41 
 
 		 828 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 807 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  31.33 
 
 		 809 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 806 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 		 806 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 806 aa  376  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 830 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 		 817 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 		 732 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 		 814 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.9 
 
 		 817 aa  365  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  29.04 
 
 		 781 aa  362  1e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 		 797 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  27.95 
 
 		 793 aa  357  5e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.55 
 
 		 798 aa  353  8e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  30.63 
 
 		 808 aa  352  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  32.65 
 
 		 731 aa  347  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  35 
 
 		 729 aa  346  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  31.96 
 
 		 809 aa  345  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 831 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 731 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  31.44 
 
 		 798 aa  337  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  31.44 
 
 		 798 aa  337  7e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.31 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 		 737 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  28.27 
 
 		 792 aa  335  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  34.5 
 
 		 737 aa  334  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 727 aa  333  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  32.24 
 
 		 742 aa  332  1e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  34.64 
 
 		 737 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  33.89 
 
 		 731 aa  331  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  29.2 
 
 		 783 aa  329  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 732 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>