More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1927 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  52.57 
 
 		 765 aa  660    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  63.46 
 
 		 830 aa  881    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  62.06 
 
 		 817 aa  845    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  69.29 
 
 		 775 aa  1015    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  63.67 
 
 		 802 aa  886    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 795 aa  1573    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  61.83 
 
 		 824 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  60.32 
 
 		 760 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  61.05 
 
 		 777 aa  822    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  65.17 
 
 		 813 aa  888    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  51.42 
 
 		 805 aa  615  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.56 
 
 		 812 aa  548  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  44.49 
 
 		 839 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  42.95 
 
 		 834 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  39.15 
 
 		 815 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  43.57 
 
 		 847 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 		 847 aa  485  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.09 
 
 		 838 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  40.69 
 
 		 811 aa  479  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  44.58 
 
 		 851 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 824 aa  476  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.34 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  40.71 
 
 		 811 aa  475  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 		 799 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 		 882 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  39.65 
 
 		 806 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  37.28 
 
 		 799 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 803 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  41.21 
 
 		 824 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 		 803 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.98 
 
 		 807 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.16 
 
 		 799 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  41.32 
 
 		 846 aa  459  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 		 799 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 		 803 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  37.42 
 
 		 799 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.12 
 
 		 797 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.66 
 
 		 795 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 814 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  41.55 
 
 		 823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  35.52 
 
 		 799 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  37.06 
 
 		 792 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  36.86 
 
 		 813 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 		 802 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.51 
 
 		 790 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.98 
 
 		 792 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.56 
 
 		 849 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  41.22 
 
 		 816 aa  445  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 861 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 		 826 aa  446  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  41.27 
 
 		 800 aa  441  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.49 
 
 		 824 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  34.76 
 
 		 791 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  33.03 
 
 		 820 aa  438  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.25 
 
 		 811 aa  433  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.54 
 
 		 787 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.36 
 
 		 787 aa  429  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 		 810 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 802 aa  423  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  35.13 
 
 		 819 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  36.69 
 
 		 794 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  33.46 
 
 		 796 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 818 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  33.11 
 
 		 791 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 		 743 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 731 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  34.25 
 
 		 735 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 807 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  31.01 
 
 		 828 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.31 
 
 		 807 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  35.46 
 
 		 731 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 		 738 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  35.19 
 
 		 732 aa  364  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  34.82 
 
 		 728 aa  363  5.0000000000000005e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.47 
 
 		 806 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  37.18 
 
 		 807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.73 
 
 		 797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.91 
 
 		 806 aa  357  5e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 		 806 aa  357  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  35.37 
 
 		 733 aa  356  7.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  37.23 
 
 		 807 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  30.75 
 
 		 789 aa  356  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 814 aa  355  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 794 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 		 762 aa  352  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.03 
 
 		 793 aa  351  3e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  34.54 
 
 		 839 aa  350  4e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 		 761 aa  350  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  30.92 
 
 		 744 aa  350  7e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 		 732 aa  349  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.24 
 
 		 894 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3789  copper-translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 860 aa  348  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  37.95 
 
 		 758 aa  348  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  39.64 
 
 		 648 aa  348  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 721 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.72 
 
 		 798 aa  347  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.72 
 
 		 798 aa  347  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  38.13 
 
 		 758 aa  347  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.33 
 
 		 798 aa  346  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>