More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4307 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  56.29 
 
 
824 aa  751    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  59.45 
 
 
802 aa  770    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  60.24 
 
 
775 aa  813    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  60.32 
 
 
795 aa  767    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  58.99 
 
 
817 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  59.66 
 
 
813 aa  771    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
760 aa  1491    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  55.14 
 
 
765 aa  669    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  59.48 
 
 
830 aa  774    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  59.97 
 
 
777 aa  778    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 
805 aa  618  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
812 aa  527  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  45.8 
 
 
839 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.3 
 
 
847 aa  502  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  44.58 
 
 
834 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  44.04 
 
 
847 aa  501  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  43.73 
 
 
846 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  43.13 
 
 
811 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  43.09 
 
 
882 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
824 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  42.96 
 
 
824 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
815 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  43.21 
 
 
811 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  43.38 
 
 
851 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
814 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  43.11 
 
 
802 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.54 
 
 
838 aa  465  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
823 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 
849 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  43.34 
 
 
861 aa  460  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  42.4 
 
 
816 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  39.27 
 
 
794 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  37.03 
 
 
807 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
794 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 
824 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  37.02 
 
 
799 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 
799 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 
803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.01 
 
 
826 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
803 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
799 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.33 
 
 
795 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.38 
 
 
799 aa  442  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.54 
 
 
790 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 
799 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 
806 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  35.01 
 
 
791 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 
800 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  36.76 
 
 
799 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 
799 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
792 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.82 
 
 
787 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
802 aa  426  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  36.44 
 
 
813 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 
797 aa  429  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.41 
 
 
787 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.98 
 
 
820 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.64 
 
 
819 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  35.83 
 
 
796 aa  416  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.98 
 
 
792 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.18 
 
 
811 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 
743 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
810 aa  404  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 
791 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
818 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  36.81 
 
 
731 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.39 
 
 
731 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
732 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  36.17 
 
 
735 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  36.84 
 
 
728 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
762 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
806 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
738 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  36.85 
 
 
733 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
761 aa  369  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.84 
 
 
797 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
806 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.08 
 
 
817 aa  364  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  35.01 
 
 
793 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.49 
 
 
793 aa  363  6e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.21 
 
 
828 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  31.92 
 
 
808 aa  361  4e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 
807 aa  359  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  37.98 
 
 
729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  38.07 
 
 
732 aa  358  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
794 aa  358  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  38.17 
 
 
727 aa  357  5e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.11 
 
 
809 aa  357  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  38.82 
 
 
792 aa  355  1e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 
789 aa  355  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  38.9 
 
 
758 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  35.75 
 
 
790 aa  353  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
798 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  34.1 
 
 
787 aa  352  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.88 
 
 
805 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1637  copper(heavy metal)-transporting P-type ATPase  32.48 
 
 
786 aa  352  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0337983  hitchhiker  0.000242946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  36.58 
 
 
807 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 
737 aa  351  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  32.37 
 
 
797 aa  351  3e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>