More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0014 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  56.83 
 
 		 749 aa  739    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  53.93 
 
 		 758 aa  683    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  53.77 
 
 		 743 aa  733    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 732 aa  1472    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  91.26 
 
 		 731 aa  1325    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  76.84 
 
 		 733 aa  1098    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  81.42 
 
 		 735 aa  1187    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  90.85 
 
 		 731 aa  1321    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  54.27 
 
 		 758 aa  662    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  47.78 
 
 		 728 aa  601  1e-170  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 		 738 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  45.01 
 
 		 752 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  44.62 
 
 		 752 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  46.6 
 
 		 809 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  45.57 
 
 		 724 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 762 aa  543  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  45.03 
 
 		 746 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 755 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  45.88 
 
 		 729 aa  532  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  43.28 
 
 		 761 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  45.64 
 
 		 721 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  44.33 
 
 		 732 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  43.35 
 
 		 757 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  43.34 
 
 		 787 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  45.15 
 
 		 727 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 648 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 		 737 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 737 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  45.84 
 
 		 737 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.98 
 
 		 707 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  45.37 
 
 		 731 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 803 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 		 812 aa  438  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 		 803 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.42 
 
 		 803 aa  432  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  34.56 
 
 		 799 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  34.56 
 
 		 799 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.29 
 
 		 799 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  34.74 
 
 		 799 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  33.79 
 
 		 799 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 799 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.47 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.61 
 
 		 838 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 806 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 		 797 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  33.24 
 
 		 796 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.08 
 
 		 794 aa  404  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  36.77 
 
 		 834 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  32.33 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.42 
 
 		 828 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  33.56 
 
 		 792 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.16 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  33.29 
 
 		 787 aa  399  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.38 
 
 		 790 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.2 
 
 		 813 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.21 
 
 		 826 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 791 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 792 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.26 
 
 		 811 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 811 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 		 815 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  36.58 
 
 		 816 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  35.83 
 
 		 846 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 		 741 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 		 824 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  32.32 
 
 		 787 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 		 824 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  33.84 
 
 		 819 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 		 882 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 		 793 aa  378  1e-103  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  36.23 
 
 		 748 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.14 
 
 		 765 aa  373  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  36.64 
 
 		 823 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  37.15 
 
 		 800 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 		 814 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  36.26 
 
 		 800 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 		 802 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  32.91 
 
 		 791 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.26 
 
 		 806 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.13 
 
 		 790 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  35.77 
 
 		 802 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.53 
 
 		 797 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  34.4 
 
 		 777 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 		 813 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 		 824 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  35.72 
 
 		 760 aa  365  2e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  34.53 
 
 		 817 aa  364  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  31.56 
 
 		 743 aa  364  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  34.52 
 
 		 847 aa  363  8e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.35 
 
 		 732 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.3 
 
 		 806 aa  361  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  32.39 
 
 		 818 aa  361  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.71 
 
 		 797 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  34.83 
 
 		 792 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 793 aa  358  1.9999999999999998e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  34.69 
 
 		 792 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.96 
 
 		 817 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>