More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2044 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  46.95 
 
 		 802 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  46.17 
 
 		 882 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  46.93 
 
 		 847 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  47.09 
 
 		 851 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  45.28 
 
 		 811 aa  677    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  42.71 
 
 		 787 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.72 
 
 		 799 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  46.53 
 
 		 823 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  45.73 
 
 		 814 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  51.91 
 
 		 812 aa  817    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  46.05 
 
 		 824 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 		 849 aa  656    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 834 aa  1667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  54.24 
 
 		 838 aa  831    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  45.31 
 
 		 816 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  45.54 
 
 		 824 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  43.92 
 
 		 791 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  43.02 
 
 		 799 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  42.82 
 
 		 799 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  47.17 
 
 		 806 aa  721    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 		 799 aa  654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 		 799 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  48.58 
 
 		 861 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  42.89 
 
 		 799 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  43.14 
 
 		 799 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  43.23 
 
 		 787 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  47.08 
 
 		 800 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.07 
 
 		 790 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  42.15 
 
 		 803 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  42.27 
 
 		 803 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  43.97 
 
 		 826 aa  649    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  46.33 
 
 		 811 aa  689    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  47.15 
 
 		 819 aa  706    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  52.66 
 
 		 839 aa  809    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 847 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 803 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  51.03 
 
 		 846 aa  775    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 794 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  41.66 
 
 		 797 aa  634  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 802 aa  630  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 		 815 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  41.05 
 
 		 813 aa  626  1e-178  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 		 807 aa  625  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.02 
 
 		 795 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.65 
 
 		 824 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  39.12 
 
 		 820 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  39.75 
 
 		 794 aa  592  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  40.8 
 
 		 792 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  39.31 
 
 		 796 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 		 792 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  42.7 
 
 		 811 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 		 810 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 		 818 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  37.22 
 
 		 791 aa  550  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  41.93 
 
 		 775 aa  523  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  43.3 
 
 		 765 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  43.22 
 
 		 805 aa  508  9.999999999999999e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 		 795 aa  505  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  44.58 
 
 		 760 aa  490  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 		 828 aa  487  1e-136  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  41.96 
 
 		 830 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  42.46 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  41.28 
 
 		 813 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.47 
 
 		 824 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  40.97 
 
 		 802 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  31.95 
 
 		 793 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  41.74 
 
 		 817 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 807 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  31.86 
 
 		 806 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 		 808 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 		 807 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  40.15 
 
 		 807 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  40.15 
 
 		 807 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  38.9 
 
 		 738 aa  450  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 		 806 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 814 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  37.26 
 
 		 731 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 		 806 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  34.81 
 
 		 743 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  35.18 
 
 		 798 aa  432  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  37.62 
 
 		 831 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  36.2 
 
 		 735 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  34.46 
 
 		 797 aa  429  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.97 
 
 		 797 aa  425  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 894 aa  424  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 731 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  38.93 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 		 793 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 		 809 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.16 
 
 		 742 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.92 
 
 		 817 aa  414  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  36.64 
 
 		 732 aa  416  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  34.22 
 
 		 750 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  37.71 
 
 		 794 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  33.94 
 
 		 798 aa  412  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.08 
 
 		 797 aa  411  1e-113  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  33.02 
 
 		 818 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  34.81 
 
 		 817 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  36.09 
 
 		 799 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  33.94 
 
 		 798 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>