More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0667 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  65.93 
 
 		 737 aa  847    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  61.53 
 
 		 731 aa  803    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  65.93 
 
 		 737 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  64.86 
 
 		 727 aa  848    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  62.26 
 
 		 732 aa  859    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  66.71 
 
 		 737 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  100 
 
 		 729 aa  1441    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  46.63 
 
 		 752 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  45.62 
 
 		 752 aa  571  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  45.37 
 
 		 757 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  47.37 
 
 		 755 aa  553  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  47.64 
 
 		 724 aa  549  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  46.8 
 
 		 762 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 761 aa  549  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  46.35 
 
 		 738 aa  548  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  44.1 
 
 		 735 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  46.6 
 
 		 733 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  45.66 
 
 		 731 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  45.09 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  45.64 
 
 		 732 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  43.27 
 
 		 787 aa  531  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.22 
 
 		 648 aa  529  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  48.01 
 
 		 743 aa  531  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  47.36 
 
 		 721 aa  525  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 728 aa  525  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  46.9 
 
 		 809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  46.71 
 
 		 746 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.12 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  45.33 
 
 		 758 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  43.77 
 
 		 758 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  44.13 
 
 		 749 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 		 838 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.45 
 
 		 818 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 846 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.89 
 
 		 795 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 		 794 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.81 
 
 		 828 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 		 803 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.16 
 
 		 803 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  35.25 
 
 		 794 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 		 812 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.46 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.45 
 
 		 790 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 834 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.7 
 
 		 790 aa  378  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.19 
 
 		 802 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  33.52 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 813 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  34.64 
 
 		 787 aa  375  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.36 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 815 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  34.04 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  35.54 
 
 		 806 aa  374  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  34.04 
 
 		 799 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  36.31 
 
 		 826 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 		 797 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  34.04 
 
 		 799 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  33.62 
 
 		 791 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 		 792 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  36.58 
 
 		 792 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  33.95 
 
 		 787 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  36.75 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  36.33 
 
 		 741 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 732 aa  365  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  34.93 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  36.78 
 
 		 792 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  34.58 
 
 		 789 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 		 799 aa  364  4e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.41 
 
 		 797 aa  364  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 		 775 aa  364  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 799 aa  363  8e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  36.78 
 
 		 882 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.76 
 
 		 740 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 816 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  35.14 
 
 		 805 aa  358  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 		 824 aa  357  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 799 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  36.55 
 
 		 765 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  31.62 
 
 		 750 aa  356  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 		 799 aa  356  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.44 
 
 		 793 aa  356  8.999999999999999e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  35.28 
 
 		 799 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 		 800 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  37.41 
 
 		 739 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 		 824 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  34.45 
 
 		 732 aa  353  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  31.41 
 
 		 753 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.82 
 
 		 817 aa  350  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  36.85 
 
 		 814 aa  350  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  32.59 
 
 		 793 aa  347  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1916  copper-translocating P-type ATPase  32.91 
 
 		 791 aa  345  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3524  heavy metal translocating P-type ATPase  35.67 
 
 		 813 aa  346  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.39 
 
 		 752 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.78 
 
 		 808 aa  345  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 807 aa  345  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  37.09 
 
 		 748 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3376  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 819 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  35.7 
 
 		 800 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>