More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3665 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 749 aa  1463    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  58.71 
 
 		 743 aa  783    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  58.31 
 
 		 733 aa  800    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  55.79 
 
 		 758 aa  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  58.14 
 
 		 731 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  56.83 
 
 		 735 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  58.41 
 
 		 731 aa  813    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  56.28 
 
 		 758 aa  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  56.81 
 
 		 732 aa  794    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  47.43 
 
 		 738 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  46.58 
 
 		 728 aa  558  1e-157  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  46.65 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  43.36 
 
 		 752 aa  522  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 746 aa  521  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 721 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  44.01 
 
 		 732 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  42.38 
 
 		 752 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  45.91 
 
 		 809 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  43.63 
 
 		 755 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  42.76 
 
 		 762 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  46.73 
 
 		 648 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  42.47 
 
 		 787 aa  491  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  42.64 
 
 		 761 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 757 aa  486  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  43.24 
 
 		 731 aa  483  1e-135  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  43.25 
 
 		 729 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  44.1 
 
 		 737 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 		 737 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  43.13 
 
 		 737 aa  465  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  43.99 
 
 		 707 aa  455  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.76 
 
 		 803 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.86 
 
 		 803 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  34.63 
 
 		 803 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.88 
 
 		 795 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.15 
 
 		 799 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  32.96 
 
 		 799 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 799 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 797 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  36.29 
 
 		 838 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 		 794 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  33.24 
 
 		 799 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 799 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.82 
 
 		 799 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  35.05 
 
 		 806 aa  396  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 		 807 aa  393  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 828 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 		 792 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  36.38 
 
 		 826 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.81 
 
 		 846 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.64 
 
 		 813 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.27 
 
 		 790 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  37.53 
 
 		 765 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 812 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.17 
 
 		 818 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  33.97 
 
 		 815 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.61 
 
 		 796 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 		 792 aa  369  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  35.73 
 
 		 816 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  31.68 
 
 		 814 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 819 aa  365  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  34.27 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 882 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 792 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 824 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 823 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  31.09 
 
 		 791 aa  363  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.79 
 
 		 824 aa  363  9e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.82 
 
 		 793 aa  361  3e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 808 aa  361  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.04 
 
 		 811 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 824 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  31.76 
 
 		 787 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 834 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  31.39 
 
 		 787 aa  357  5e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  31.52 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.17 
 
 		 807 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 802 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  35.5 
 
 		 807 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  34.36 
 
 		 811 aa  352  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  35.41 
 
 		 814 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  32.59 
 
 		 794 aa  348  2e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30.75 
 
 		 802 aa  347  4e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 		 740 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  32.13 
 
 		 809 aa  345  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  28.89 
 
 		 820 aa  344  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 800 aa  344  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 775 aa  343  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 		 795 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 		 741 aa  341  4e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  27.66 
 
 		 806 aa  340  8e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 		 806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 		 806 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 		 797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3348  cation-transporting ATPase transmembrane protein  36.18 
 
 		 748 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  32.49 
 
 		 839 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  35 
 
 		 804 aa  335  2e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2769  heavy metal translocating P-type ATPase  36.6 
 
 		 739 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0304144  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 		 824 aa  333  9e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>