More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1796 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  54.71 
 
 		 762 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  54.24 
 
 		 752 aa  777    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  54.74 
 
 		 757 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  54.42 
 
 		 761 aa  711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  53.29 
 
 		 787 aa  711    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  55.49 
 
 		 752 aa  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  57.74 
 
 		 746 aa  733    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 724 aa  1429    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  55.73 
 
 		 755 aa  757    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  50.56 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  48.11 
 
 		 733 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  45.92 
 
 		 735 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  51.61 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  46.06 
 
 		 731 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  45.49 
 
 		 731 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 		 707 aa  555  1e-156  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  45.48 
 
 		 732 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  47.02 
 
 		 743 aa  553  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  47.64 
 
 		 729 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  48.65 
 
 		 737 aa  548  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 		 732 aa  540  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  48.75 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  48.35 
 
 		 737 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  48.49 
 
 		 737 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  46.7 
 
 		 727 aa  527  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  46.48 
 
 		 728 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  46.21 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  48.15 
 
 		 721 aa  512  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  46.78 
 
 		 758 aa  501  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  44.86 
 
 		 731 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  47.28 
 
 		 749 aa  475  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.43 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.15 
 
 		 828 aa  399  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  33.02 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  33.02 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  33.11 
 
 		 807 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.88 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  35.86 
 
 		 846 aa  375  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.13 
 
 		 804 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  33.95 
 
 		 797 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 		 803 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  33.02 
 
 		 799 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 813 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 803 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  33.24 
 
 		 803 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.44 
 
 		 799 aa  368  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.69 
 
 		 795 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 		 799 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 		 794 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  35.39 
 
 		 740 aa  365  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.29 
 
 		 797 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  35.9 
 
 		 838 aa  364  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 		 818 aa  364  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 809 aa  363  6e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 798 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 799 aa  362  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 819 aa  362  1e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.07 
 
 		 793 aa  362  1e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  31.84 
 
 		 802 aa  361  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.22 
 
 		 790 aa  361  2e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3217  heavy metal translocating P-type ATPase  35.99 
 
 		 741 aa  360  7e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.84 
 
 		 811 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  34.79 
 
 		 800 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 808 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  33.8 
 
 		 793 aa  356  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.27 
 
 		 732 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 		 806 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  30.93 
 
 		 793 aa  355  2e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 818 aa  355  2e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  35.34 
 
 		 811 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.49 
 
 		 806 aa  353  4e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  32.3 
 
 		 791 aa  353  5e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.21 
 
 		 807 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  33.98 
 
 		 826 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 739 aa  352  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 		 790 aa  351  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  32.67 
 
 		 794 aa  351  3e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  29.64 
 
 		 820 aa  351  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 		 799 aa  351  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.55 
 
 		 814 aa  351  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 		 839 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 		 806 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  33.89 
 
 		 732 aa  349  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  32.5 
 
 		 792 aa  348  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  34.29 
 
 		 799 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 742 aa  347  3e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 		 824 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  31.96 
 
 		 724 aa  347  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 		 882 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 815 aa  346  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  35.57 
 
 		 816 aa  346  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.68 
 
 		 805 aa  345  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  34.15 
 
 		 799 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  35.74 
 
 		 824 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  35.25 
 
 		 823 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  33.57 
 
 		 787 aa  343  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 789 aa  343  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  34.07 
 
 		 792 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.61 
 
 		 765 aa  343  8e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>