More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5929 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  54.74 
 
 		 724 aa  713    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  59.95 
 
 		 761 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  54.21 
 
 		 752 aa  794    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  54.66 
 
 		 752 aa  789    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  60.35 
 
 		 762 aa  842    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 757 aa  1512    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  53.06 
 
 		 746 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  63.86 
 
 		 787 aa  902    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  53.79 
 
 		 755 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  48.18 
 
 		 738 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.54 
 
 		 648 aa  578  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.59 
 
 		 707 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  48.74 
 
 		 809 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  45.6 
 
 		 728 aa  548  1e-154  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  44.32 
 
 		 732 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  45.52 
 
 		 729 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  44.63 
 
 		 743 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  44.76 
 
 		 735 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  45.37 
 
 		 737 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  44.04 
 
 		 733 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  43.3 
 
 		 732 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  44.67 
 
 		 727 aa  526  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  45.7 
 
 		 737 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  43.54 
 
 		 731 aa  525  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  42.82 
 
 		 731 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  46.37 
 
 		 737 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  43.79 
 
 		 721 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 758 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 		 731 aa  488  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  43.24 
 
 		 758 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 749 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  36.23 
 
 		 846 aa  402  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 		 743 aa  384  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.66 
 
 		 828 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  31.89 
 
 		 807 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.83 
 
 		 838 aa  369  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 815 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  32.27 
 
 		 797 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 		 812 aa  365  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 815 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.47 
 
 		 793 aa  364  3e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  31.24 
 
 		 802 aa  362  2e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.8 
 
 		 790 aa  361  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  32.45 
 
 		 794 aa  360  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 818 aa  359  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.29 
 
 		 798 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.75 
 
 		 797 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.42 
 
 		 796 aa  357  5e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  31.47 
 
 		 793 aa  355  1e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  31.81 
 
 		 803 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  31.16 
 
 		 813 aa  353  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  31.9 
 
 		 808 aa  353  7e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  30.33 
 
 		 797 aa  353  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 803 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  31.06 
 
 		 803 aa  352  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.38 
 
 		 807 aa  350  6e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 		 802 aa  350  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.01 
 
 		 795 aa  350  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 803 aa  350  7e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.23 
 
 		 802 aa  350  7e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.32 
 
 		 799 aa  349  9e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  32.87 
 
 		 798 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  32.87 
 
 		 798 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 834 aa  348  2e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 		 799 aa  348  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 835 aa  348  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  34.34 
 
 		 765 aa  347  4e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 807 aa  347  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1407  heavy metal translocating P-type ATPase  32.4 
 
 		 758 aa  347  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.688507  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 		 799 aa  346  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 799 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  30.85 
 
 		 799 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  31 
 
 		 794 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.99 
 
 		 817 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 		 791 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  33.24 
 
 		 792 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.28 
 
 		 796 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  34.23 
 
 		 807 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  31.19 
 
 		 742 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 817 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 		 799 aa  340  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 		 807 aa  340  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  30.59 
 
 		 799 aa  340  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.66 
 
 		 799 aa  340  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.77 
 
 		 805 aa  339  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 806 aa  339  9e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  32.97 
 
 		 792 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  31.55 
 
 		 831 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  31.05 
 
 		 791 aa  339  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 826 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  33.42 
 
 		 811 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  33.47 
 
 		 804 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 		 800 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  31.75 
 
 		 787 aa  337  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  33.52 
 
 		 817 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  30.91 
 
 		 814 aa  335  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  32.92 
 
 		 813 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  34.37 
 
 		 802 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 819 aa  333  6e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>