More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5920 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  51.92 
 
 		 752 aa  751    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  53.79 
 
 		 757 aa  712    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  49.35 
 
 		 787 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  55.73 
 
 		 724 aa  740    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  51.45 
 
 		 762 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  55.2 
 
 		 746 aa  702    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  52.21 
 
 		 752 aa  741    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  51.81 
 
 		 761 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 755 aa  1501    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.23 
 
 		 648 aa  562  1.0000000000000001e-159  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  45.94 
 
 		 738 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  46.36 
 
 		 732 aa  550  1e-155  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 		 743 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  47.44 
 
 		 737 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  43.85 
 
 		 733 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  47.59 
 
 		 707 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  46.38 
 
 		 727 aa  537  1e-151  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 737 aa  537  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  44.48 
 
 		 728 aa  534  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  47.73 
 
 		 737 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  47.37 
 
 		 729 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  42.6 
 
 		 735 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  41.65 
 
 		 732 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  42.28 
 
 		 731 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  42.06 
 
 		 731 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  43.85 
 
 		 809 aa  502  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 758 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  43.59 
 
 		 731 aa  478  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 758 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  43.02 
 
 		 721 aa  466  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  43.44 
 
 		 749 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  34.84 
 
 		 828 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 806 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.12 
 
 		 765 aa  374  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.24 
 
 		 812 aa  372  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  31.66 
 
 		 796 aa  362  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  31.6 
 
 		 807 aa  361  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 818 aa  360  5e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  30.51 
 
 		 818 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 826 aa  356  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.5 
 
 		 798 aa  354  4e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.59 
 
 		 797 aa  353  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  30.38 
 
 		 791 aa  352  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 		 813 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.09 
 
 		 802 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  32.09 
 
 		 802 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.21 
 
 		 808 aa  351  2e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  31.72 
 
 		 799 aa  351  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  34.05 
 
 		 804 aa  350  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  27.86 
 
 		 817 aa  349  1e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  31.1 
 
 		 803 aa  349  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  31.9 
 
 		 803 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.56 
 
 		 795 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 		 790 aa  346  8e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  33.65 
 
 		 846 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 		 802 aa  346  1e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  31.61 
 
 		 819 aa  345  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  31.32 
 
 		 793 aa  345  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.54 
 
 		 807 aa  344  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  30.82 
 
 		 803 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  29.71 
 
 		 743 aa  343  5.999999999999999e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 		 838 aa  343  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  32.11 
 
 		 792 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  30.73 
 
 		 803 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  30.43 
 
 		 799 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  30.43 
 
 		 799 aa  341  4e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 791 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  32.81 
 
 		 834 aa  340  8e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.87 
 
 		 796 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  30.4 
 
 		 799 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  30.82 
 
 		 797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3106  copper-translocating P-type ATPase  30 
 
 		 742 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  28.06 
 
 		 793 aa  336  7.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  31.16 
 
 		 790 aa  336  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.32 
 
 		 799 aa  336  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 839 aa  336  1e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 787 aa  335  2e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  29.89 
 
 		 815 aa  335  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  30.57 
 
 		 799 aa  334  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  31.64 
 
 		 740 aa  335  3e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  30.58 
 
 		 794 aa  334  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  32.91 
 
 		 811 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  32.25 
 
 		 837 aa  333  6e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  31.28 
 
 		 742 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10590  copper/silver-translocating P-type ATPase  32.09 
 
 		 755 aa  332  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11171  normal  0.524998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 815 aa  332  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  30.67 
 
 		 799 aa  331  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  31.61 
 
 		 787 aa  331  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  33.02 
 
 		 811 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  29.17 
 
 		 839 aa  330  6e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  29.49 
 
 		 744 aa  330  7e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  28.8 
 
 		 797 aa  330  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  32.68 
 
 		 839 aa  329  9e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  30.54 
 
 		 799 aa  329  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  27.51 
 
 		 806 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  32.92 
 
 		 823 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0020  heavy metal-transporting ATPase  32.04 
 
 		 746 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.668167 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  29.88 
 
 		 798 aa  328  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  29.88 
 
 		 798 aa  328  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  31.87 
 
 		 837 aa  328  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>