More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1796 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  43.5 
 
 		 796 aa  689    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  70.46 
 
 		 799 aa  1137    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  49.37 
 
 		 787 aa  740    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  45.38 
 
 		 820 aa  684    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  71.84 
 
 		 799 aa  1171    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  49.12 
 
 		 791 aa  773    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  71.09 
 
 		 799 aa  1160    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 		 794 aa  1104    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  49.24 
 
 		 790 aa  755    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  70.59 
 
 		 799 aa  1136    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  70.96 
 
 		 799 aa  1157    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  43.91 
 
 		 838 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  48.99 
 
 		 787 aa  734    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  71.09 
 
 		 799 aa  1160    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  67.8 
 
 		 792 aa  1088    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  62.9 
 
 		 813 aa  1018    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  66.54 
 
 		 792 aa  1063    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  65.76 
 
 		 807 aa  1102    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  41.68 
 
 		 791 aa  647    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  70.96 
 
 		 803 aa  1167    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  71.21 
 
 		 803 aa  1167    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  67.38 
 
 		 797 aa  1095    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  44.97 
 
 		 811 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  45.04 
 
 		 811 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  43.61 
 
 		 815 aa  643    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  70.96 
 
 		 803 aa  1168    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  100 
 
 		 795 aa  1630    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  70.12 
 
 		 799 aa  1144    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  47.81 
 
 		 802 aa  720    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  44.1 
 
 		 816 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 		 812 aa  616  1e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  41.38 
 
 		 806 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 882 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  43.8 
 
 		 800 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  42.71 
 
 		 824 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  42.59 
 
 		 824 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.98 
 
 		 826 aa  599  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  40.89 
 
 		 839 aa  599  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  43.84 
 
 		 802 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  42.47 
 
 		 846 aa  593  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  42.59 
 
 		 823 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  41.46 
 
 		 814 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 		 834 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  39.88 
 
 		 819 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.89 
 
 		 824 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  41.13 
 
 		 794 aa  579  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 		 828 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.34 
 
 		 818 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  38.13 
 
 		 861 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 849 aa  501  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 847 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 		 847 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 806 aa  480  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  35.68 
 
 		 806 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  37.13 
 
 		 808 aa  474  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.04 
 
 		 811 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  35.89 
 
 		 814 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 810 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  36.3 
 
 		 809 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  35.35 
 
 		 807 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.92 
 
 		 765 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  36.25 
 
 		 805 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  35.07 
 
 		 851 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 743 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  33.58 
 
 		 817 aa  441  9.999999999999999e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 		 738 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 		 775 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 		 795 aa  432  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  32.13 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  35.26 
 
 		 807 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  36.12 
 
 		 777 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  32.05 
 
 		 793 aa  419  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.89 
 
 		 807 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  35.26 
 
 		 807 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 		 802 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  35.63 
 
 		 813 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  35.64 
 
 		 831 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  35.56 
 
 		 733 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  35.66 
 
 		 824 aa  408  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  37.33 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  34.89 
 
 		 830 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 735 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  34.03 
 
 		 728 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 793 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 792 aa  399  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.21 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  33.93 
 
 		 731 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  35.01 
 
 		 817 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  33.98 
 
 		 732 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  32.52 
 
 		 809 aa  388  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  31.38 
 
 		 789 aa  389  1e-106  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 		 732 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  34.56 
 
 		 794 aa  385  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 797 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  31.42 
 
 		 781 aa  385  1e-105  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  32.12 
 
 		 797 aa  383  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  32.63 
 
 		 752 aa  382  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  35.89 
 
 		 729 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 814 aa  379  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  32.71 
 
 		 783 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>