More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1996 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  76.59 
 
 		 882 aa  1186    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  76.59 
 
 		 824 aa  1189    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  42.61 
 
 		 819 aa  642    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  76.07 
 
 		 800 aa  1134    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.86 
 
 		 799 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 823 aa  1649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  46.98 
 
 		 846 aa  638    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  85.8 
 
 		 824 aa  1325    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.96 
 
 		 812 aa  676    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  46.84 
 
 		 834 aa  663    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  75.16 
 
 		 802 aa  1144    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  80.99 
 
 		 816 aa  1259    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  77.21 
 
 		 824 aa  1190    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  76.83 
 
 		 814 aa  1172    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  42.8 
 
 		 799 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  45.04 
 
 		 806 aa  651    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  46.08 
 
 		 815 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  75.06 
 
 		 811 aa  1196    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  44.69 
 
 		 839 aa  637    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  41.71 
 
 		 803 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 		 803 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 		 797 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  75.31 
 
 		 811 aa  1198    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  49.94 
 
 		 838 aa  730    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 803 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  42.18 
 
 		 799 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 799 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  42.18 
 
 		 799 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  41 
 
 		 807 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  42.59 
 
 		 795 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  42.43 
 
 		 799 aa  627  1e-178  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  42.43 
 
 		 799 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.04 
 
 		 790 aa  625  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  40.58 
 
 		 794 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  41.33 
 
 		 791 aa  616  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 		 791 aa  617  1e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  43.21 
 
 		 826 aa  616  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  40.4 
 
 		 796 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  38.9 
 
 		 820 aa  602  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  42.79 
 
 		 787 aa  599  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 		 792 aa  600  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 		 792 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  42.14 
 
 		 787 aa  598  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  40.8 
 
 		 813 aa  593  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  41.41 
 
 		 794 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 		 802 aa  579  1e-164  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44 
 
 		 849 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 		 847 aa  549  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  41.25 
 
 		 847 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 861 aa  544  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  40.98 
 
 		 851 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 		 818 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  42 
 
 		 775 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  42.82 
 
 		 765 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  38.98 
 
 		 811 aa  483  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 		 810 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  41.02 
 
 		 824 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  34.63 
 
 		 828 aa  462  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  43.33 
 
 		 760 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 		 813 aa  457  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  41.42 
 
 		 795 aa  459  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 802 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  40.39 
 
 		 777 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  37.18 
 
 		 807 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.32 
 
 		 807 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  38.23 
 
 		 830 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  39.95 
 
 		 743 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 805 aa  436  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.73 
 
 		 806 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.65 
 
 		 793 aa  432  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  41.24 
 
 		 817 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 808 aa  426  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 		 806 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  37.45 
 
 		 738 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  36.89 
 
 		 807 aa  426  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.46 
 
 		 797 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.01 
 
 		 809 aa  415  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 		 814 aa  412  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  33.33 
 
 		 805 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  34.98 
 
 		 835 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 		 728 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.7 
 
 		 798 aa  399  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.33 
 
 		 806 aa  399  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  36.06 
 
 		 809 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  35.15 
 
 		 735 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  33.06 
 
 		 805 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  33.06 
 
 		 805 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 731 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  31.69 
 
 		 806 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.92 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.92 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.57 
 
 		 731 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 732 aa  392  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 732 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.92 
 
 		 805 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.81 
 
 		 806 aa  392  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.37 
 
 		 743 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.6 
 
 		 799 aa  388  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 796 aa  388  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>