More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1195 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  79.2 
 
 		 851 aa  1257    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  98.11 
 
 		 847 aa  1665    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.12 
 
 		 812 aa  648    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  55.15 
 
 		 849 aa  793    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  46.47 
 
 		 834 aa  645    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 847 aa  1696    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  54.15 
 
 		 861 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  45.48 
 
 		 839 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  43.85 
 
 		 811 aa  612  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  45.07 
 
 		 838 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 		 810 aa  607  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  43.1 
 
 		 846 aa  585  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  40.02 
 
 		 815 aa  582  1e-164  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  43.86 
 
 		 882 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  42.42 
 
 		 811 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  42.3 
 
 		 811 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  43.38 
 
 		 824 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  43.7 
 
 		 824 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  43.26 
 
 		 814 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  43.69 
 
 		 800 aa  565  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 819 aa  557  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 802 aa  543  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.06 
 
 		 790 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 816 aa  538  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  39.49 
 
 		 806 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  41.76 
 
 		 823 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.32 
 
 		 799 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  36.44 
 
 		 799 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.32 
 
 		 803 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 		 797 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 		 803 aa  522  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  36.44 
 
 		 799 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 		 799 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.99 
 
 		 803 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 		 826 aa  521  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  36.32 
 
 		 791 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  35.84 
 
 		 799 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  45.23 
 
 		 765 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.67 
 
 		 824 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  43.05 
 
 		 775 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 		 802 aa  515  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.16 
 
 		 794 aa  512  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.66 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  36.32 
 
 		 799 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  36.2 
 
 		 799 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.95 
 
 		 787 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 		 813 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 805 aa  497  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  35.04 
 
 		 791 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.79 
 
 		 807 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 		 792 aa  492  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  35.32 
 
 		 794 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  34.97 
 
 		 787 aa  488  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  42.17 
 
 		 830 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  34.59 
 
 		 792 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  43.01 
 
 		 824 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  34.55 
 
 		 796 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  39.52 
 
 		 807 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  43.44 
 
 		 795 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  43.55 
 
 		 760 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 813 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  41.45 
 
 		 802 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  42.84 
 
 		 777 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.26 
 
 		 818 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 820 aa  454  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 		 807 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 806 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  39.81 
 
 		 807 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  40.84 
 
 		 817 aa  432  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.33 
 
 		 793 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  33.09 
 
 		 814 aa  415  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  32.25 
 
 		 807 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  31.32 
 
 		 828 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.73 
 
 		 806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.41 
 
 		 806 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  36.65 
 
 		 831 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  31.96 
 
 		 808 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 809 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  29.79 
 
 		 789 aa  395  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  28.49 
 
 		 817 aa  389  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 743 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  34.73 
 
 		 731 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.76 
 
 		 798 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  30.54 
 
 		 818 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.42 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 1071 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.28 
 
 		 805 aa  379  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.86 
 
 		 1087 aa  379  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  31.89 
 
 		 942 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.98 
 
 		 797 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  33.77 
 
 		 837 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 738 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0477  copper-exporting ATPase  34.19 
 
 		 742 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1690  copper-translocating P-type ATPase  34.19 
 
 		 740 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  34.28 
 
 		 809 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3877  copper-translocating P-type ATPase  31.97 
 
 		 760 aa  373  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00336349  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  31.4 
 
 		 798 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.78 
 
 		 815 aa  375  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  34.04 
 
 		 814 aa  376  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>