More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2416 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  100 
 
 		 794 aa  1632    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  40.9 
 
 		 791 aa  607  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  42.89 
 
 		 787 aa  599  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  42.57 
 
 		 787 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.82 
 
 		 790 aa  601  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  41.41 
 
 		 815 aa  597  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  42.63 
 
 		 799 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  43.32 
 
 		 811 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.03 
 
 		 838 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 		 803 aa  595  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  41.72 
 
 		 803 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  40.4 
 
 		 794 aa  591  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  41.59 
 
 		 803 aa  590  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.72 
 
 		 799 aa  587  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  43.04 
 
 		 811 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.75 
 
 		 812 aa  583  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  39.98 
 
 		 807 aa  582  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  41.5 
 
 		 799 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  41.12 
 
 		 799 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  41.13 
 
 		 795 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  41.12 
 
 		 799 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 		 806 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 813 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  40.18 
 
 		 797 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  41.37 
 
 		 799 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  41.56 
 
 		 799 aa  565  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 		 792 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 834 aa  559  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 791 aa  560  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  42.36 
 
 		 800 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 		 802 aa  555  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  38.57 
 
 		 839 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  41.41 
 
 		 823 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 		 846 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  41.28 
 
 		 816 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.98 
 
 		 826 aa  549  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 824 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  40.88 
 
 		 824 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  38.51 
 
 		 819 aa  543  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 882 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  37.96 
 
 		 820 aa  540  9.999999999999999e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  37.97 
 
 		 796 aa  536  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.77 
 
 		 802 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  38.79 
 
 		 792 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 		 824 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 		 814 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 		 861 aa  513  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 		 849 aa  502  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.12 
 
 		 818 aa  493  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 847 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 847 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  39.89 
 
 		 765 aa  476  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  35.89 
 
 		 851 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 		 811 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  33.21 
 
 		 828 aa  443  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  33.95 
 
 		 807 aa  433  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 		 809 aa  430  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  35.15 
 
 		 810 aa  432  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  37.32 
 
 		 775 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 808 aa  426  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 		 806 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  39.27 
 
 		 760 aa  419  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  37.43 
 
 		 805 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 806 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  34.36 
 
 		 807 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 		 807 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 777 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 		 824 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 		 807 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.85 
 
 		 806 aa  399  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  35.22 
 
 		 743 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  30.98 
 
 		 793 aa  395  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 		 830 aa  391  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.71 
 
 		 814 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  37.14 
 
 		 817 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 792 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 		 795 aa  386  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  35.49 
 
 		 729 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.96 
 
 		 817 aa  379  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 798 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  32.3 
 
 		 809 aa  379  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.08 
 
 		 797 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.02 
 
 		 796 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  32.89 
 
 		 794 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 732 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  33.15 
 
 		 793 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 		 728 aa  366  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 815 aa  363  9e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 798 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  32.47 
 
 		 798 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  28.5 
 
 		 781 aa  362  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  32.32 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  31.91 
 
 		 797 aa  361  3e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  31.32 
 
 		 803 aa  360  5e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 831 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  33.52 
 
 		 733 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  30.87 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  33.11 
 
 		 789 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  30.7 
 
 		 797 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 		 789 aa  356  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>