More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1842 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  62.96 
 
 
729 aa  825    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  65.79 
 
 
737 aa  868    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  66.34 
 
 
737 aa  875    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
732 aa  1440    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  65.93 
 
 
737 aa  874    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  59.06 
 
 
731 aa  795    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  61.42 
 
 
727 aa  832    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  47.37 
 
 
752 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  48.23 
 
 
761 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  47.27 
 
 
752 aa  582  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  47.52 
 
 
762 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
738 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
755 aa  550  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  44.39 
 
 
787 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  46.9 
 
 
721 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  44.32 
 
 
757 aa  532  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  45.85 
 
 
707 aa  531  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 
724 aa  527  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  47.07 
 
 
648 aa  525  1e-148  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  45.44 
 
 
728 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  42.51 
 
 
735 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
731 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  47.36 
 
 
743 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  45.01 
 
 
733 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  44.22 
 
 
732 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  47.08 
 
 
809 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  43.83 
 
 
731 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  44.99 
 
 
758 aa  488  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
746 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  43.89 
 
 
758 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  44.82 
 
 
749 aa  463  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  38.09 
 
 
838 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.53 
 
 
828 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
846 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
818 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
812 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 
826 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.56 
 
 
790 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  37.74 
 
 
834 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.7 
 
 
795 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  31.51 
 
 
794 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  35.84 
 
 
839 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  39.12 
 
 
765 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  33.52 
 
 
803 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  35.92 
 
 
819 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 
803 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  32.88 
 
 
799 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 
807 aa  379  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  34.37 
 
 
813 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  33.24 
 
 
803 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0654  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.24 
 
 
732 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  36.46 
 
 
790 aa  374  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  36.07 
 
 
806 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 
767 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  35.05 
 
 
799 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
800 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0631  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
800 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  34.61 
 
 
792 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4578  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
799 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530867  decreased coverage  0.00687508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.14 
 
 
817 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 
799 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  35.65 
 
 
797 aa  366  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  32.32 
 
 
787 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0750  copper-translocating P-type ATPase  34.75 
 
 
732 aa  364  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  32.47 
 
 
787 aa  364  4e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  36.99 
 
 
811 aa  363  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  34.34 
 
 
794 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  36.63 
 
 
824 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  36.63 
 
 
882 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  31.01 
 
 
793 aa  362  2e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  31.93 
 
 
799 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  31.93 
 
 
799 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  36.21 
 
 
824 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  30.97 
 
 
802 aa  360  5e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  32.77 
 
 
799 aa  360  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  37.04 
 
 
811 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  33.8 
 
 
815 aa  359  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
823 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  37.02 
 
 
739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  32.03 
 
 
807 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  34.67 
 
 
792 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  37.76 
 
 
775 aa  358  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  31.79 
 
 
799 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2938  copper-translocating P-type ATPase  34.91 
 
 
795 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4872  heavy metal translocating P-type ATPase  36.03 
 
 
816 aa  355  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  31.18 
 
 
797 aa  354  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  34.87 
 
 
804 aa  353  5e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
799 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3691  heavy metal translocating P-type ATPase  32.5 
 
 
793 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.55 
 
 
806 aa  353  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  29.89 
 
 
806 aa  353  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
831 aa  352  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.25 
 
 
797 aa  352  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
847 aa  352  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  29.24 
 
 
797 aa  351  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3543  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
740 aa  351  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.415996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  31.65 
 
 
799 aa  351  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  35.23 
 
 
811 aa  351  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.41 
 
 
806 aa  350  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  33.01 
 
 
799 aa  350  8e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>