More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1365 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
810 aa  1654    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  84.2 
 
 
811 aa  1329    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.5 
 
 
847 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  44.14 
 
 
847 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  45.61 
 
 
849 aa  625  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  44.15 
 
 
851 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  44.95 
 
 
861 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.48 
 
 
812 aa  594  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  42.09 
 
 
834 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  41.17 
 
 
839 aa  566  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  40.05 
 
 
838 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  40.47 
 
 
811 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  39.68 
 
 
846 aa  523  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
806 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
824 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  40.12 
 
 
811 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
814 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
882 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  39.37 
 
 
824 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.07 
 
 
802 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.1 
 
 
795 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.48 
 
 
790 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
797 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  36.4 
 
 
791 aa  495  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  37.17 
 
 
807 aa  492  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.87 
 
 
794 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
803 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.52 
 
 
799 aa  488  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  35.37 
 
 
803 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.71 
 
 
799 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
803 aa  486  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  35.54 
 
 
819 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  38.49 
 
 
816 aa  482  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  35.95 
 
 
799 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
799 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  37.06 
 
 
787 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  35.72 
 
 
802 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
800 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
824 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  39.14 
 
 
823 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 
792 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
799 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  36.42 
 
 
815 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  35.52 
 
 
826 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  38.81 
 
 
777 aa  464  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  36.3 
 
 
787 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  35.15 
 
 
794 aa  457  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  35.83 
 
 
799 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  37.73 
 
 
775 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  35.95 
 
 
799 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  38.15 
 
 
765 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  34.46 
 
 
813 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  35.32 
 
 
792 aa  450  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  34.8 
 
 
791 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 
805 aa  439  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.41 
 
 
820 aa  428  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  38.01 
 
 
795 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  32.8 
 
 
796 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.71 
 
 
818 aa  416  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  35.81 
 
 
813 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
802 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  37.86 
 
 
760 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.48 
 
 
807 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  33.21 
 
 
807 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
807 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
807 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.17 
 
 
806 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  31.22 
 
 
828 aa  387  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  29.84 
 
 
806 aa  383  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  35.89 
 
 
824 aa  382  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.29 
 
 
806 aa  382  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
809 aa  375  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  36.14 
 
 
830 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 
732 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  35.7 
 
 
817 aa  363  7.0000000000000005e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.8 
 
 
797 aa  357  5e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  31.66 
 
 
798 aa  355  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  30.22 
 
 
814 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  29.94 
 
 
808 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.2 
 
 
817 aa  350  5e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  34.9 
 
 
743 aa  346  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  27.91 
 
 
793 aa  345  2e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  31.4 
 
 
798 aa  344  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  31.4 
 
 
798 aa  344  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  32.87 
 
 
731 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  32.73 
 
 
731 aa  341  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  28.68 
 
 
781 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  29.28 
 
 
783 aa  338  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  29.66 
 
 
783 aa  334  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  29.26 
 
 
783 aa  333  6e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  34.5 
 
 
737 aa  333  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  34.17 
 
 
737 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  34.07 
 
 
733 aa  332  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 
809 aa  331  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  34.12 
 
 
729 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  32.56 
 
 
831 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.66 
 
 
796 aa  328  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  32.59 
 
 
732 aa  328  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  34.5 
 
 
737 aa  327  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  31.7 
 
 
735 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>