More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1990 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  44.34 
 
 		 799 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  100 
 
 		 820 aa  1689    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.87 
 
 		 799 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  44.21 
 
 		 787 aa  694    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  44.58 
 
 		 787 aa  677    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  44.46 
 
 		 792 aa  674    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 813 aa  694    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  44.46 
 
 		 799 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  45.4 
 
 		 807 aa  719    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  44.58 
 
 		 791 aa  723    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  44.99 
 
 		 794 aa  716    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  41.08 
 
 		 791 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  44.43 
 
 		 799 aa  682    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  43.64 
 
 		 796 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  44.76 
 
 		 803 aa  689    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  44.98 
 
 		 803 aa  692    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  44.02 
 
 		 797 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  44.8 
 
 		 803 aa  694    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 792 aa  687    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  45.38 
 
 		 795 aa  699    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  44.46 
 
 		 799 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  44.68 
 
 		 799 aa  671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  45.41 
 
 		 802 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  43.75 
 
 		 799 aa  691    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  44.89 
 
 		 790 aa  709    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.87 
 
 		 812 aa  628  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  40.63 
 
 		 815 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  39.95 
 
 		 811 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  37.76 
 
 		 846 aa  592  1e-168  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  39.09 
 
 		 811 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  35.93 
 
 		 826 aa  588  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  38.27 
 
 		 838 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  39.12 
 
 		 834 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 806 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  39.32 
 
 		 800 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  36.83 
 
 		 819 aa  568  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  38.9 
 
 		 823 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  38.95 
 
 		 824 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  39.71 
 
 		 802 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 882 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  38.83 
 
 		 824 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  38.23 
 
 		 816 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  38.68 
 
 		 824 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  38.1 
 
 		 814 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  37.96 
 
 		 794 aa  552  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 818 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.1 
 
 		 828 aa  498  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.53 
 
 		 861 aa  468  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  33.74 
 
 		 814 aa  456  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 847 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.58 
 
 		 849 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 847 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  33.13 
 
 		 851 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.29 
 
 		 809 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  31.39 
 
 		 807 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  33.13 
 
 		 808 aa  440  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  33.15 
 
 		 775 aa  431  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  32.13 
 
 		 765 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  33.53 
 
 		 811 aa  429  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 		 824 aa  429  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  32.16 
 
 		 806 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  31.52 
 
 		 807 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  32.04 
 
 		 806 aa  422  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  31.48 
 
 		 807 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  33.03 
 
 		 795 aa  415  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  31.36 
 
 		 807 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  32.57 
 
 		 777 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  32.89 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  33.11 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 802 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  30.6 
 
 		 817 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  32.41 
 
 		 810 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  31.68 
 
 		 743 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  31.21 
 
 		 830 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  30.66 
 
 		 789 aa  390  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  30.01 
 
 		 806 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  32.98 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.73 
 
 		 793 aa  381  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  32.04 
 
 		 828 aa  379  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  28.91 
 
 		 809 aa  379  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  30.24 
 
 		 738 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  30.32 
 
 		 839 aa  374  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  31.69 
 
 		 828 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  30.6 
 
 		 831 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  30.7 
 
 		 792 aa  372  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  30.09 
 
 		 814 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  30.4 
 
 		 828 aa  368  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.82 
 
 		 805 aa  366  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  29.83 
 
 		 735 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  29.21 
 
 		 728 aa  369  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  31.02 
 
 		 817 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  31.59 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  30.22 
 
 		 731 aa  364  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  30.74 
 
 		 794 aa  363  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  32.03 
 
 		 748 aa  361  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  29.88 
 
 		 821 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  30.69 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  30.01 
 
 		 797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>