More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2781 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  57.12 
 
 		 765 aa  806    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 805 aa  1582    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  48.84 
 
 		 775 aa  631  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  50.2 
 
 		 802 aa  600  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  49.26 
 
 		 777 aa  600  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  48.78 
 
 		 813 aa  594  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  51.63 
 
 		 760 aa  595  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  49.8 
 
 		 824 aa  590  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  51.02 
 
 		 795 aa  590  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  49.46 
 
 		 817 aa  572  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  47.74 
 
 		 830 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 		 812 aa  547  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  43.89 
 
 		 839 aa  534  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  44.72 
 
 		 847 aa  500  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  43.6 
 
 		 834 aa  502  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  42.65 
 
 		 838 aa  499  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 847 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  41.63 
 
 		 846 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  44.25 
 
 		 851 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 803 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.88 
 
 		 803 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 		 803 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  33.82 
 
 		 802 aa  477  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  37.27 
 
 		 799 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 		 799 aa  479  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.48 
 
 		 799 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 799 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.48 
 
 		 799 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.68 
 
 		 797 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.28 
 
 		 795 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 807 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 799 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  35.91 
 
 		 794 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  41.97 
 
 		 861 aa  461  9.999999999999999e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 		 826 aa  462  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 		 813 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  37.47 
 
 		 815 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 		 806 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  39.84 
 
 		 811 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  41.73 
 
 		 849 aa  446  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  39.67 
 
 		 811 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  42.02 
 
 		 800 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  34.63 
 
 		 791 aa  441  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  40.27 
 
 		 882 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  37.21 
 
 		 794 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 791 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 		 802 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  40 
 
 		 824 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  33.76 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  34.7 
 
 		 792 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  35.57 
 
 		 819 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  39.86 
 
 		 824 aa  432  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  39.78 
 
 		 814 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  37.79 
 
 		 811 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  35.32 
 
 		 796 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  39.75 
 
 		 823 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  38.78 
 
 		 816 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  32.89 
 
 		 820 aa  417  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  36.19 
 
 		 792 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.48 
 
 		 824 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  33.81 
 
 		 787 aa  415  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  33.55 
 
 		 787 aa  403  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  32.7 
 
 		 806 aa  389  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 		 743 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  36.17 
 
 		 738 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  32.06 
 
 		 828 aa  378  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 		 707 aa  373  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  32.75 
 
 		 808 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  36.94 
 
 		 727 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.29 
 
 		 818 aa  375  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 807 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  33.51 
 
 		 809 aa  364  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  33.29 
 
 		 752 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.02 
 
 		 793 aa  360  4e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  32.21 
 
 		 814 aa  360  8e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  36.09 
 
 		 793 aa  359  9.999999999999999e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  36.45 
 
 		 737 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  36.65 
 
 		 737 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  37.52 
 
 		 648 aa  358  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 		 737 aa  358  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.53 
 
 		 797 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 		 761 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  29.6 
 
 		 817 aa  355  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  35.06 
 
 		 733 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 732 aa  354  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  29.43 
 
 		 797 aa  355  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  35.41 
 
 		 729 aa  351  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  32.85 
 
 		 752 aa  349  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  33.73 
 
 		 794 aa  348  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  30.81 
 
 		 798 aa  346  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.31 
 
 		 796 aa  346  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  32.9 
 
 		 787 aa  346  8.999999999999999e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  30.09 
 
 		 805 aa  345  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  36.74 
 
 		 758 aa  345  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  37.47 
 
 		 809 aa  343  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  32.06 
 
 		 750 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  34.24 
 
 		 735 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 806 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>