More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0934 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  51.69 
 
 
787 aa  807    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  45.41 
 
 
820 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 
799 aa  743    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.25 
 
 
799 aa  769    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  47.62 
 
 
799 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  47.95 
 
 
807 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 
812 aa  638    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  47.62 
 
 
799 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
799 aa  755    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  47.81 
 
 
795 aa  741    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  46.99 
 
 
794 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  50.69 
 
 
790 aa  817    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 
838 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  47.86 
 
 
792 aa  742    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  48.12 
 
 
792 aa  749    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  47.25 
 
 
803 aa  769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  46.84 
 
 
813 aa  742    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
802 aa  1652    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  42.61 
 
 
796 aa  663    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  43.11 
 
 
791 aa  659    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  49.75 
 
 
791 aa  805    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
799 aa  756    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  47.38 
 
 
803 aa  763    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  47.5 
 
 
803 aa  769    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 
799 aa  743    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  48.88 
 
 
797 aa  774    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  51.82 
 
 
787 aa  818    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
834 aa  628  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  40.94 
 
 
815 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  40.54 
 
 
806 aa  622  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  39.9 
 
 
839 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  39.24 
 
 
846 aa  618  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  38.49 
 
 
819 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  39.93 
 
 
811 aa  594  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  40.49 
 
 
811 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  38.7 
 
 
794 aa  581  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
816 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  40.22 
 
 
800 aa  575  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  36.61 
 
 
826 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
824 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  39.85 
 
 
882 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  40.1 
 
 
824 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
823 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.35 
 
 
824 aa  554  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
814 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
802 aa  551  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
847 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
847 aa  522  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  35.86 
 
 
818 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  34.75 
 
 
851 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.19 
 
 
828 aa  500  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  36.02 
 
 
861 aa  496  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
849 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
807 aa  492  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1619  heavy metal translocating P-type ATPase  33.76 
 
 
965 aa  483  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.265996  unclonable  0.00000000106661 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  35.34 
 
 
811 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  34.41 
 
 
805 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  33.94 
 
 
806 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  33.99 
 
 
806 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  35.72 
 
 
810 aa  462  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  34.66 
 
 
765 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  35.21 
 
 
808 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  32.27 
 
 
793 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.31 
 
 
809 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 
775 aa  439  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  34.44 
 
 
814 aa  434  1e-120  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  31.8 
 
 
807 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  32.36 
 
 
817 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  31.11 
 
 
807 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
738 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  33.15 
 
 
733 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  32.04 
 
 
789 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  30.74 
 
 
807 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  31.63 
 
 
777 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  31.6 
 
 
731 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 
824 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  31.33 
 
 
731 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 
795 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
760 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  33.61 
 
 
813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  32.32 
 
 
732 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
797 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  32.5 
 
 
831 aa  405  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  30.38 
 
 
792 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  31.57 
 
 
809 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  33.06 
 
 
802 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  31.83 
 
 
830 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  32.14 
 
 
743 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 
797 aa  399  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  32.55 
 
 
735 aa  399  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  31.92 
 
 
806 aa  398  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  32.24 
 
 
798 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  32.27 
 
 
762 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  31.94 
 
 
761 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  32.61 
 
 
743 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  30.97 
 
 
732 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  33.33 
 
 
729 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 
727 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  32.01 
 
 
796 aa  378  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  32.56 
 
 
799 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>