More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1990 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  47.12 
 
 		 787 aa  729    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  45.4 
 
 		 820 aa  702    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  43.11 
 
 		 796 aa  691    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  66.13 
 
 		 799 aa  1110    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  67.66 
 
 		 794 aa  1120    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  66.54 
 
 		 799 aa  1098    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 		 815 aa  641    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  71.45 
 
 		 792 aa  1156    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  71.29 
 
 		 792 aa  1158    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 		 799 aa  1097    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  62.42 
 
 		 813 aa  1028    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  46.44 
 
 		 791 aa  739    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  43.03 
 
 		 791 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  65.34 
 
 		 803 aa  1093    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  65.51 
 
 		 803 aa  1097    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  66.67 
 
 		 799 aa  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  65.14 
 
 		 797 aa  1091    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  48.19 
 
 		 790 aa  747    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  47.69 
 
 		 787 aa  746    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  66.05 
 
 		 803 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 		 799 aa  1108    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  66.29 
 
 		 799 aa  1096    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  43.25 
 
 		 811 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  65.76 
 
 		 795 aa  1102    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 807 aa  1672    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  66.67 
 
 		 799 aa  1107    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  48.07 
 
 		 802 aa  746    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  43.07 
 
 		 811 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  41.1 
 
 		 838 aa  619  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  40.93 
 
 		 846 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  42.06 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  41.94 
 
 		 824 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  42.08 
 
 		 824 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  42.24 
 
 		 802 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  40.45 
 
 		 806 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  42.41 
 
 		 800 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  40.76 
 
 		 834 aa  597  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  41.69 
 
 		 814 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  40.86 
 
 		 823 aa  592  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.66 
 
 		 812 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  40.75 
 
 		 816 aa  588  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  39.3 
 
 		 819 aa  580  1e-164  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  39.98 
 
 		 794 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  39.63 
 
 		 839 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 		 824 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.24 
 
 		 826 aa  557  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1619  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 		 965 aa  525  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.265996  unclonable  0.00000000106661 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.8 
 
 		 818 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.61 
 
 		 828 aa  512  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 		 849 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  35.91 
 
 		 847 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  34.72 
 
 		 806 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  37.39 
 
 		 861 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  35.79 
 
 		 847 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  34.23 
 
 		 806 aa  478  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 		 811 aa  475  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  35.22 
 
 		 765 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 		 807 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  37.17 
 
 		 810 aa  457  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  35.8 
 
 		 805 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  32.6 
 
 		 793 aa  448  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  34.47 
 
 		 809 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 807 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 808 aa  443  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  35.13 
 
 		 851 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  33.05 
 
 		 814 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 743 aa  442  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 		 775 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 806 aa  435  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  32.8 
 
 		 789 aa  434  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1927  heavy metal translocating P-type ATPase  35.72 
 
 		 795 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  34.34 
 
 		 807 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  34.22 
 
 		 807 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 		 792 aa  429  1e-118  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 		 777 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  34.93 
 
 		 813 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  36.28 
 
 		 824 aa  425  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0998  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 802 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  34.89 
 
 		 738 aa  425  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  32.44 
 
 		 797 aa  422  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  31.88 
 
 		 817 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  32.43 
 
 		 797 aa  418  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1521  heavy metal translocating P-type ATPase  35.96 
 
 		 830 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0875658  normal  0.721674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4307  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 		 760 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.6 
 
 		 798 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 		 731 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  34.94 
 
 		 831 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  35.81 
 
 		 733 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  34.51 
 
 		 731 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  34.89 
 
 		 794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.79 
 
 		 802 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  34.44 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  31.78 
 
 		 805 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  35.73 
 
 		 793 aa  399  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  31.38 
 
 		 809 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 707 aa  397  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  33.1 
 
 		 735 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  32.04 
 
 		 806 aa  397  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  31.78 
 
 		 806 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>