More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1813 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  58.52 
 
 
814 aa  939    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
809 aa  1640    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1177  copper-translocating P-type ATPase  43.09 
 
 
807 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  63.99 
 
 
808 aa  1036    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  56.88 
 
 
807 aa  949    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1237  heavy metal translocating P-type ATPase  43.58 
 
 
807 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1339  heavy metal translocating P-type ATPase  43.67 
 
 
807 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527377  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  43.19 
 
 
806 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  42.75 
 
 
806 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  36.95 
 
 
828 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
818 aa  511  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  39.7 
 
 
794 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  38.51 
 
 
797 aa  498  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1848  copper-translocating P-type ATPase  39.19 
 
 
743 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.525064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
798 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  37.71 
 
 
815 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
802 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  38.46 
 
 
802 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
815 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
794 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  39.6 
 
 
799 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  38.21 
 
 
817 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  39.23 
 
 
803 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  34.51 
 
 
817 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  35.22 
 
 
791 aa  479  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1225  heavy metal translocating P-type ATPase  43.42 
 
 
944 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0625797  normal  0.577313 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  35.11 
 
 
793 aa  473  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
818 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
796 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  35.12 
 
 
805 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  37.9 
 
 
836 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
786 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  37.68 
 
 
866 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  36.3 
 
 
795 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  38.32 
 
 
821 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.47 
 
 
790 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 
797 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  38.1 
 
 
837 aa  457  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
798 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
798 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  35.19 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  35.4 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.01 
 
 
806 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
836 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
753 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  35.13 
 
 
806 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  36.29 
 
 
797 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 
806 aa  458  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  35.4 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  35.27 
 
 
805 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  35.07 
 
 
805 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  35.27 
 
 
805 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  37.32 
 
 
837 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
814 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
806 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  35.51 
 
 
792 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 
866 aa  449  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
828 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  38.08 
 
 
823 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.91 
 
 
894 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  34.47 
 
 
807 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1562  heavy metal translocating P-type ATPase  37.65 
 
 
773 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  35.99 
 
 
742 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 
752 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  36.04 
 
 
861 aa  444  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 
885 aa  444  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  36.32 
 
 
828 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2532  heavy metal translocating P-type ATPase  39.08 
 
 
762 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0349499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 
794 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  35.77 
 
 
828 aa  442  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1730  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
839 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0385  copper-transporter ATPase CopA  36.64 
 
 
744 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  38.73 
 
 
793 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3240  heavy metal translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
852 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1952  putative cation-transporting ATPase membrane protein  37.16 
 
 
724 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.51624  normal  0.45395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1876  heavy metal translocating P-type ATPase  37.97 
 
 
748 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.972303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.31 
 
 
787 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  36.37 
 
 
837 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  36.27 
 
 
889 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  35.38 
 
 
803 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1581  heavy metal translocating P-type ATPase  37.96 
 
 
755 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.4 
 
 
799 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 
846 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  39.31 
 
 
801 aa  439  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  35.47 
 
 
851 aa  439  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  34.52 
 
 
796 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4316  heavy metal translocating P-type ATPase  35.85 
 
 
835 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  36.04 
 
 
744 aa  437  1e-121  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  35.45 
 
 
889 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  35.09 
 
 
826 aa  438  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.97 
 
 
803 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  35.3 
 
 
976 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  34.69 
 
 
799 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  34.41 
 
 
799 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1548  copper-translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
813 aa  435  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0486383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  38.28 
 
 
792 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  33.79 
 
 
797 aa  434  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  34.66 
 
 
942 aa  434  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3161  copper-translocating P-type ATPase  38.36 
 
 
795 aa  436  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  34.69 
 
 
799 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>