More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2345 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  66.62 
 
 		 729 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  99.05 
 
 		 737 aa  1426    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  61.94 
 
 		 731 aa  802    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  65.79 
 
 		 732 aa  904    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 		 737 aa  1436    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  67.78 
 
 		 727 aa  898    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  91.99 
 
 		 737 aa  1283    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  49.5 
 
 		 752 aa  630  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  49 
 
 		 752 aa  605  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  47.72 
 
 		 755 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  45.8 
 
 		 761 aa  568  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  48.16 
 
 		 738 aa  568  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  46.77 
 
 		 762 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  45.7 
 
 		 757 aa  554  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1796  heavy metal translocating P-type ATPase  48.49 
 
 		 724 aa  555  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  47.74 
 
 		 733 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  46.5 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  48.02 
 
 		 743 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  45.99 
 
 		 731 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1670  heavy metal translocating P-type ATPase  49.54 
 
 		 648 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  46.02 
 
 		 732 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  44.6 
 
 		 735 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  46.92 
 
 		 728 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2393  nitrogen fixation protein FixI  43.35 
 
 		 787 aa  523  1e-147  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  47.12 
 
 		 809 aa  523  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  46.44 
 
 		 746 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2572  heavy metal translocating P-type ATPase  46.42 
 
 		 707 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2443  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 		 721 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415649  normal  0.66709 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  47.12 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  46.43 
 
 		 758 aa  501  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3665  copper-translocating P-type ATPase  44.7 
 
 		 749 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.385709 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 		 818 aa  428  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 		 828 aa  410  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  40.44 
 
 		 765 aa  405  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.83 
 
 		 799 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 		 803 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  34.6 
 
 		 803 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  34.13 
 
 		 803 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  34.18 
 
 		 799 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  34.18 
 
 		 799 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  37.15 
 
 		 838 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  37.89 
 
 		 846 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  36.69 
 
 		 806 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  33.66 
 
 		 799 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.75 
 
 		 839 aa  381  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  33.19 
 
 		 799 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.38 
 
 		 812 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 799 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.41 
 
 		 795 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  33.62 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  33.38 
 
 		 807 aa  380  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  33.71 
 
 		 799 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.5 
 
 		 797 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  33.2 
 
 		 813 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  33.57 
 
 		 792 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0805  copper-translocating P-type ATPase  35.4 
 
 		 831 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  37.64 
 
 		 834 aa  372  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  32.68 
 
 		 797 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.28 
 
 		 790 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  37.94 
 
 		 882 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  36.18 
 
 		 805 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  36.64 
 
 		 792 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  37.08 
 
 		 790 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  33.61 
 
 		 794 aa  368  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 824 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  38.22 
 
 		 811 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  34.61 
 
 		 787 aa  365  1e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  35.65 
 
 		 815 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  37.8 
 
 		 824 aa  365  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  32.96 
 
 		 802 aa  365  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  32.2 
 
 		 802 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0034  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 767 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  35.88 
 
 		 826 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3535  copper-translocating P-type ATPase  38.41 
 
 		 739 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.253095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  34.28 
 
 		 819 aa  363  8e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  32.92 
 
 		 796 aa  363  9e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  36.5 
 
 		 792 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  30.86 
 
 		 798 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  38.72 
 
 		 800 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  36.27 
 
 		 793 aa  360  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  36.74 
 
 		 811 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  36.15 
 
 		 804 aa  358  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0586  heavy metal translocating P-type ATPase  36.45 
 
 		 799 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.943128 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  38.19 
 
 		 775 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0661  copper-translocating P-type ATPase  37.38 
 
 		 797 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.99 
 
 		 796 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  29.6 
 
 		 793 aa  358  1.9999999999999998e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  32.82 
 
 		 789 aa  358  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0625  heavy metal translocating P-type ATPase  36.59 
 
 		 799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0643992  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.18 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  33.47 
 
 		 791 aa  355  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.45 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  31.49 
 
 		 752 aa  355  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  32.45 
 
 		 805 aa  355  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  30.93 
 
 		 815 aa  355  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  34.08 
 
 		 803 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0938  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 730 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.485974 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1082  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 730 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  32.45 
 
 		 805 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>